分子生物學(xué)的研究方向范文
時間:2023-12-29 17:52:03
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篇1
摘要從教學(xué)內(nèi)容、教學(xué)過程和考核方式等方面介紹了研究生細胞分子生物學(xué)課程的教學(xué)開展與體會,為適應(yīng)多研究方向的研究生培養(yǎng)要求、提高教學(xué)效果提供參考。
關(guān)鍵詞研究生;細胞分子生物學(xué);教學(xué);內(nèi)容;考核
揚州大學(xué)碩士研究生培養(yǎng)方案課程設(shè)置將細胞分子生物學(xué)作為生物學(xué)一級學(xué)科的學(xué)位課程,包含植物學(xué)、動物學(xué)、生理學(xué)、水生生物學(xué)、微生物學(xué)、遺傳學(xué)、發(fā)育生物學(xué)、細胞生物學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)、生物物理學(xué)、生態(tài)學(xué)等11個生物學(xué)二級學(xué)科。揚州大學(xué)是江蘇省屬重點綜合性大學(xué),目前設(shè)有27個學(xué)院,11個生物學(xué)二級學(xué)科分散在生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、農(nóng)學(xué)院、獸醫(yī)學(xué)院、醫(yī)學(xué)院,各二級學(xué)科的研究方向也較廣泛,如何適應(yīng)這種多學(xué)院、多學(xué)科和多研究方向的碩士研究生培養(yǎng)要求,提高教學(xué)效果,揚州大學(xué)不斷進行嘗試、改革,構(gòu)建了適合各二級學(xué)科培養(yǎng)目標(biāo)要求的細胞分子生物學(xué)教學(xué)體系,現(xiàn)將這門課程的教學(xué)內(nèi)容、教學(xué)過程和考核方式介紹如下。
1細胞分子生物學(xué)的教學(xué)內(nèi)容
細胞分子生物學(xué)是隨著細胞生物學(xué)和分子生物學(xué)發(fā)展而興起的一門較新的學(xué)科,是一門在分子水平上研究基因?qū)毎顒诱{(diào)控以及各種細胞結(jié)構(gòu)的形成和功能執(zhí)行的科學(xué)[1]。對生物學(xué)專業(yè)的研究生來講,本科階段都學(xué)過細胞生物學(xué)和分子生物學(xué)這2門課程,因此研究生所開設(shè)的細胞分子生物學(xué)課程體系應(yīng)該和本科生的課程體系有所區(qū)別。由于傳統(tǒng)的細胞分子生物學(xué)教材與細胞生物學(xué)和分子生物學(xué)在內(nèi)容上有很多雷同,若采用這些教材,很容易使研究生對該門課程失去興趣。揚州大學(xué)將該門課程的教學(xué)內(nèi)容分為4個部分:細胞結(jié)構(gòu)、細胞遺傳、細胞代謝與調(diào)控、細胞發(fā)育,該校沒有選擇任何固定教材,僅僅指定少數(shù)最新出版的教材作為參考書,如韓貽仁主編的分子細胞生物學(xué)[2]、Gerald Karp主編的Cell and Molecular Biology:Concepts and Experi-ments等[3]。
2細胞分子生物學(xué)的教學(xué)過程
揚州大學(xué)細胞分子生物學(xué)的授課對象差異比較大,學(xué)生的來源和專業(yè)背景也不同,在教學(xué)過程中,筆者嘗試使用開放式教師、開放式教學(xué)和開放式課堂的教學(xué)方法。
2.1開放式教師
以往的研究生課程都是由固定的教師一上到底,由于教師的精力有限,不可能對細胞生物學(xué)各個領(lǐng)域的前沿知識都熟悉。為了解決這一問題,揚州大學(xué)采用不固定教師上課的制度,跨學(xué)科跨學(xué)院請資深教師進行授課,確保學(xué)生能夠了解該領(lǐng)域的基本知識與前沿動態(tài)。設(shè)置的4個部分教學(xué)內(nèi)容中,每一部分由1~2位專業(yè)教師負責(zé)主講,教師可結(jié)合自己的專業(yè)背景,根據(jù)不同教學(xué)模塊,設(shè)置具體的教學(xué)內(nèi)容,不拘泥于任何教科書進行授課。有些教師的研究方向是植物,對植物細胞分子生物學(xué)的研究進展和前沿動態(tài)比較熟悉,講授植物細胞分子生物學(xué)可以做到深入淺出,而對動物細胞分子生物學(xué)的講授效果會比較差,因此主講教師可選擇來自植物、動物、微生物、病毒等研究方向的老師。對于學(xué)生,有些是來源于農(nóng)學(xué)院,其背景知識和興趣側(cè)重在植物方面,而有些來源于醫(yī)學(xué)院或獸醫(yī)學(xué)院,其背景知識和興趣側(cè)重在動物方面,這就要求選擇具有不同學(xué)科背景的教師。開展開放式的教學(xué)方式,滿足不同學(xué)生的要求。
2.2開放式教學(xué)
由于細胞生物學(xué)是生命科學(xué)的前沿學(xué)科之一,因此在把握現(xiàn)有教材和參考資料的基礎(chǔ)上,教學(xué)過程中要結(jié)合實際將細胞生物學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的新進展、新知識、新方法介紹給學(xué)生,拓寬學(xué)生知識的深度、廣度,培養(yǎng)其對未來工作的適應(yīng)能力。
在每一個教學(xué)模塊中,教師可通過不同的教學(xué)方式講解不同側(cè)重點的專題。如細胞結(jié)構(gòu)部分包括講了2個專題,一個是細胞內(nèi)膜系統(tǒng):結(jié)構(gòu)、功能、蛋白質(zhì)分選和膜泡運輸,另一個是細胞骨架與細胞運動。內(nèi)膜系統(tǒng)一般是指內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體、細胞核、溶酶體和液泡(包括內(nèi)體和分泌泡)5類細胞器膜的總稱,而廣義的內(nèi)膜系統(tǒng)概念也包括線粒體、葉綠體、過氧化物酶體、細胞核等細胞內(nèi)所有細胞器膜的總稱。在本科細胞生物學(xué)教學(xué)過程中,這些細胞器的形態(tài)結(jié)構(gòu)、功能和發(fā)生是分別獨立介紹。雖然這些細胞器具有各自獨立的結(jié)構(gòu)和功能[4],但它們又是密切相關(guān)的,尤其是它們的膜結(jié)構(gòu)是可以相互轉(zhuǎn)換的,轉(zhuǎn)換的機制則是通過蛋白質(zhì)分選和膜泡運輸來實現(xiàn)的。在講授內(nèi)膜系統(tǒng)時,可通過蛋白質(zhì)合成這條線將這些相關(guān)內(nèi)容串聯(lián)起來講述。由于核糖體在蛋白質(zhì)合成上與內(nèi)膜系統(tǒng)互為一體,因此將核糖體也加入進來,同時向上講可以提及細胞核中核糖體大小亞基及mRNA的合成,向下還可講述細胞膜上的蛋白功能,從而用蛋白質(zhì)合成一條線將細胞的三大結(jié)構(gòu)即細胞膜、細胞質(zhì)和細胞核聯(lián)系了起來。同時,也啟迪研究生自己去找線索,找出一根主干,將盡可能多的內(nèi)容串起來。又如細胞骨架對于維持細胞的形態(tài)結(jié)構(gòu)及內(nèi)部結(jié)構(gòu)的有序性以及在細胞運動、物質(zhì)運輸、能量轉(zhuǎn)換、信息傳遞和細胞分化分裂等一系列方面起重要作用,因此對細胞骨架的研究是近代生命科學(xué)中最活躍的研究領(lǐng)域之一,它的快速發(fā)展主要得益于大型分析儀器的應(yīng)用和實驗方法技術(shù)的改進。在這一部分內(nèi)容的教學(xué)中,可重點向?qū)W生講解細胞骨架的研究方法,包括每種方法的原理、基本過程和結(jié)果分析,以最新的國外權(quán)威期刊上發(fā)表的細胞骨架方面的論文為例,向?qū)W生介紹細胞骨架的研究是如何開展的。
2.3開放式課堂
研究生課堂和本科生課堂相比,講授內(nèi)容量非常大。筆者一般會在課后將課件提供給學(xué)生,使他們在課堂上不用花太多精力記筆記,而是將主要精力集中到聽課上,跟著教師的引導(dǎo)考慮問題,這樣使其思維保持很高的興奮度,且感到疲勞。在嚴(yán)格遵守課堂紀(jì)律的前提下,在上課時要盡量調(diào)動學(xué)生的積極性,以開拓學(xué)生的思維,培養(yǎng)創(chuàng)造性。課后要讓學(xué)生自己閱讀指定或推薦的原始文獻,或者讓他們自己到網(wǎng)上查閱自己感興趣的問題,以此可培養(yǎng)學(xué)生閱讀文獻、查找資料、進行科研的能力。
3細胞分子生物學(xué)的考核方式
作為生物學(xué)一級學(xué)科碩士研究生的學(xué)位課程,細胞分子生物學(xué)的考核以考試為主,考慮到研究生學(xué)習(xí)細胞分子生物學(xué)課的目的主要是為了提高學(xué)生利用學(xué)到的細胞生物學(xué)知識解決課題研究中的問題,實用性較強,因此筆者選用開卷考試的形式,所出的試題都是綜合性的分析題,在考場內(nèi)學(xué)生可以查閱任何參考資料,但參考資料中沒有現(xiàn)成的答案,促使學(xué)生綜合運用所學(xué)知識,通過仔細分析才能得出答案。這種考核方式一方面提高了學(xué)生獨立思考問題和解決問題的能力,另一方面也使教師了解了學(xué)生對這門課程的掌握情況,檢驗教學(xué)質(zhì)量,很大程度上促進了以后教學(xué)的開展。
4參考文獻
[1] 王石平,金安江.分子細胞生物學(xué)研究性教學(xué)模式的改革實踐與思考[J].華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報:社會科學(xué)版,2008(2):134-137.
[2] 韓貽仁.分子細胞生物學(xué)[M].2版.北京:科學(xué)出版社,2001.
篇2
關(guān)鍵詞:研究生;醫(yī)學(xué)分子生物學(xué);教學(xué)改革
中圖分類號:G642.0 文獻標(biāo)志碼:A 文章編號:1674-9324(2013)42-0173-02
分子生物學(xué)是生命科學(xué)中發(fā)展最為迅速的前沿學(xué)科之一,其研究方法和技術(shù)廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)相關(guān)的許多學(xué)科領(lǐng)域。分子生物學(xué)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的使命,就是應(yīng)用分子生物學(xué)的理論與技術(shù),從分子水平上揭示疾病發(fā)生、發(fā)展的分子機制,進而對危害人類健康的各種疾病提供預(yù)防、診斷以及治療方法[1,2]。對醫(yī)學(xué)各專業(yè)的研究生而言,學(xué)習(xí)和掌握扎實的分子生物學(xué)知識,是將來成為合格醫(yī)學(xué)研究者和臨床工作者的內(nèi)在需求和必備條件。研究生《醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)》是本校一門重要的基礎(chǔ)課程,從1994年開設(shè)以來,一直是全校基礎(chǔ)與臨床專業(yè)共計400余人/年的碩士研究生必修課,2010年后改為選修課。然而隨著分子生物學(xué)理論和技術(shù)的日新月異,雖然教學(xué)內(nèi)容在不斷更新,但沿襲舊有的重視知識傳授而忽視學(xué)生自主學(xué)習(xí)的教學(xué)模式已經(jīng)遠遠不適應(yīng)新的教學(xué)理念需要,對新的教學(xué)模式的探索已勢在必行。
一、現(xiàn)階段存在的問題
總結(jié)多年的教學(xué)實踐,我們發(fā)現(xiàn)在《醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)》理論課教學(xué)中存在著一些問題,主要反映在:(1)課程體系及教學(xué)方法里學(xué)生自主學(xué)習(xí)、交互式團隊學(xué)習(xí)的模塊少,學(xué)生未能養(yǎng)成自主閱讀文獻、集體討論、發(fā)現(xiàn)問題和解決問題的習(xí)慣;(2)學(xué)生知識基礎(chǔ)參差不齊,專業(yè)背景及研究方向差異較大,課堂講授難度較大且有時收效不好;(3)部分內(nèi)容理論性強,較為枯燥且不屬于學(xué)生的研究方向,學(xué)生學(xué)習(xí)積極性不高;(4)在教學(xué)內(nèi)容上只關(guān)注教材講授而不重視其專業(yè)發(fā)展方面的探究,雖然分子生物學(xué)教材內(nèi)容時有更新,但相關(guān)領(lǐng)域的最新進展并不能及時涵蓋,這將使教師更新知識的主動性下降,同時研究生也會失去學(xué)習(xí)分子生物學(xué)的興趣。(5)期末考試閉卷問答式方式由于考試時間和考試內(nèi)容的限制,而不利于開拓研究生視野和創(chuàng)新意識的培養(yǎng);(6)在成績評價上,未能對學(xué)習(xí)積極的學(xué)生加以激勵。
二、教學(xué)改革內(nèi)容及方式
針對教學(xué)中存在的這些問題,我們對2012級研究生《醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)》理論課教學(xué)進行了改革嘗試。我校2012級選修《醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)》課程的研究生共279人,將其分為兩個班,其中基礎(chǔ)專業(yè)和部分臨床專業(yè)共105人為1班,其余臨床專業(yè)174人為2班。本學(xué)期對1班學(xué)生進行了教學(xué)改革活動,對2班學(xué)生仍按往年教學(xué)模式正常上課作為對比。本次教學(xué)改革活動的方式為:將1班的105名學(xué)生分成小組,每組4~5名學(xué)生。以小組為單位,要求學(xué)生課后閱讀中外文文獻,內(nèi)容可以是分子生物學(xué)方面的經(jīng)典理論、熱點問題或最新研究進展(如:PCR技術(shù)、細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)與疾病、藥物基因組學(xué))等,小組同學(xué)分析討論后將文獻內(nèi)容制作成多媒體課件,分別在學(xué)期中和學(xué)期末各抽取4~5個課時在全班進行讀書報告,每組推薦一名同學(xué)做報告,報告時間15~20分鐘,報告完畢由學(xué)生提問及老師點評,每小組共計耗時30分鐘,期末對兩個班的成績進行分析比對。
三、考試成績分析
我們對1班和2班學(xué)生的期末考試成績進行了對比。從表1可以看出,1班的考試平均成績比2班高出3.07分,且1班的最高分(88分)和最低分(59分)均分別高于2班的83分和43分。其次,1班不及格人數(shù)為1人,不及格率為0.95%;2班不及格人數(shù)為13人,不及格率為7.47%。兩班比較不及格率具有統(tǒng)計學(xué)差異(P箓0.05)。表1結(jié)果說明1班考試成績明顯超過2班。
四、本次教改活動的思考
經(jīng)過本次教改活動,我們體會到:研究生教育與本科的基礎(chǔ)教育不同,我們培養(yǎng)的研究生必須具備扎實的理論基礎(chǔ)和鮮明的創(chuàng)新性。教師雖然是授課環(huán)節(jié)中的主導(dǎo)者,但學(xué)習(xí)是互動的過程,這個過程不僅是教師在講臺上的授課過程,也應(yīng)是臺下學(xué)生主動學(xué)習(xí)的過程。因此教師在教學(xué)中除進行啟發(fā)式的教學(xué)外,還更應(yīng)該注重培養(yǎng)研究生主動學(xué)習(xí)的意識,塑造研究生的創(chuàng)新精神。本次在2012級研究生1班通過進行讀書報告,首先優(yōu)化了教學(xué)氛圍,充分調(diào)動了學(xué)生學(xué)習(xí)的積極性。通過查找文獻、歸納總結(jié)文獻并制作課件等,鍛煉了學(xué)生的科研思維能力和寫作能力;通過口頭報告鍛煉了他們的表達能力;通過小組討論鍛煉了他們的團隊協(xié)作能力。這些能力的訓(xùn)練為他們將來的研究工作和畢業(yè)論文答辯等打下了一定的基礎(chǔ)。其次,拓展了學(xué)生的知識面,有利于增強學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣。教師在課堂上的講授只有幾十分鐘,時間遠遠不夠,只能是內(nèi)容上的引導(dǎo),而切實掌握的知識還有待于學(xué)生課后的學(xué)習(xí)與思考,這就要求研究生必需樹立主人翁的意識,積極主動地完成自學(xué)過程并培養(yǎng)創(chuàng)新精神。我們在教學(xué)中也發(fā)現(xiàn),很多學(xué)生在課間以及課程結(jié)束后會主動向老師請教分子生物學(xué)方面的問題,這說明研究生的學(xué)習(xí)主動性增強了。但本次教改活動也有不足之處。從老師授課的情況和學(xué)生咨詢的問題來看,大部分研究生對實驗技術(shù)的理解及操作很弱,由于本校的《分子生物學(xué)技術(shù)》實驗課程已交給學(xué)校“醫(yī)學(xué)與生物學(xué)研究中心”實驗室承擔(dān),本次教改未能涉及到實驗技術(shù)方面的改革。因此如何提供更好的實驗室條件,加強學(xué)生的操作能力,是我們分子生物學(xué)教學(xué)改革的重要目標(biāo)。分子生物學(xué)的發(fā)展十分迅速,而本校使用的教材相對陳舊,雖然老師在講授時可以適當(dāng)介紹新的研究進展,但陳舊的教材不利于學(xué)生自學(xué)。在本次教學(xué)活動中,雖然我們考慮過師生討論、互動式的教學(xué),但由于授課人數(shù)多,學(xué)生基礎(chǔ)參差不齊,甚至少部分學(xué)生只是為了獲取學(xué)分,對本課程毫無興趣等諸多原因,最終本課程36學(xué)時的教學(xué)中,大部分仍然是采用老師講授的方式進行教學(xué)。
經(jīng)過對《醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)》這門課程的教學(xué)改革,我們雖然取得了一定的教學(xué)效果,但深知這門課程具有很強的理論性和實踐性,教師必須不斷探索合適的教學(xué)手段和教學(xué)方法。在今后的教學(xué)中,如何變革教學(xué)思路,體現(xiàn)以“醫(yī)學(xué)”為中心,并調(diào)整教學(xué)內(nèi)容使之與科研課題需求相結(jié)合,以進一步激發(fā)學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣和創(chuàng)造性思維等,將成為教研室教學(xué)改革重點思考的問題。作者認為可以考慮在授課中盡量引用科學(xué)先驅(qū)們的成功事跡,以“故事”的形式進行授課;在講解分子生物學(xué)經(jīng)典現(xiàn)象和原理時,可以從相關(guān)現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)、科學(xué)家如何提出假設(shè)、如何通過實驗證明假設(shè)的思路,在講解中引導(dǎo)學(xué)生思考,從而鍛煉學(xué)生的科研思維;在介紹新進展時應(yīng)充分結(jié)合生活中和醫(yī)學(xué)中的熱點問題進行講述,明確本學(xué)科同臨床的聯(lián)系程度,這不僅強調(diào)了學(xué)科的重要性,同時也加強了研究生學(xué)習(xí)的迫切性,使他們真正喜愛這門課程,同時能高效地接收相關(guān)理論知識,應(yīng)該會取得更好的效果。
以上是本教研室為適應(yīng)教學(xué)改革需求,在研究生層次上的分子生物學(xué)教學(xué)的一些嘗試與體會。隨著高教改革的深入進行,我們還將不斷完善、不斷總結(jié)、不斷創(chuàng)新,以使研究生的分子生物學(xué)教學(xué)走上新臺階,使學(xué)生學(xué)以致用,努力創(chuàng)新,最終成為教學(xué)、科研、醫(yī)療的棟梁之材。
基金項目:遵義醫(yī)學(xué)院教學(xué)改革項目“研究生分子生物學(xué)教學(xué)改革的研究與實踐”
篇3
【關(guān)鍵詞】分子遺傳學(xué);教學(xué);方法
分子遺傳學(xué)是在分子水平研究生命現(xiàn)象的學(xué)科,已經(jīng)成為21世紀(jì)生命科學(xué)前沿學(xué)科,它的基礎(chǔ)理論已經(jīng)滲透到生命科學(xué)幾乎所有的領(lǐng)域,是涵蓋面非常廣的一門學(xué)科,同時也是現(xiàn)代生物科學(xué)發(fā)展最快的學(xué)科之一。從分子遺傳學(xué)發(fā)展以來逐漸從重視形態(tài)、代謝功能方面的演變延伸到研究基因和基因的結(jié)構(gòu)和功能等的演變。
分子遺傳學(xué)目前已成為綜合性大學(xué)、理工科大學(xué)、農(nóng)林院校等生命科學(xué)類各專業(yè)研究生的專業(yè)學(xué)位課,是繼本科階段課程如生物化學(xué)、分子生物學(xué)、遺傳學(xué)等課程后的進一步學(xué)習(xí),對提高研究生的基本科學(xué)素質(zhì)、提升專業(yè)素養(yǎng)和增強科研創(chuàng)新等有著十分密切的聯(lián)系和重要的影響。以分子遺傳學(xué)為基礎(chǔ)的遺傳工程則正在發(fā)展成為一個新興的工業(yè)生產(chǎn)領(lǐng)域,許多國家已經(jīng)把分子遺傳學(xué)及技術(shù)列為優(yōu)先發(fā)展的高科技項目。在這樣的發(fā)展潮流中,如何使學(xué)生能夠及時了解快速發(fā)展的分子遺傳學(xué)理論和技術(shù)的相關(guān)知識,為我國生命科學(xué)培養(yǎng)富有開拓精神、創(chuàng)新精神,具有國際競爭力的高層次、高質(zhì)量的人才,研究生分子遺傳學(xué)課程的改革必將成為我們探索的一個重要課題。
一、學(xué)院特色
生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)科是生命科學(xué)領(lǐng)域發(fā)展最為迅速的前沿學(xué)科之一,也是中國計量學(xué)院近年來重點建設(shè)的學(xué)科,2004年入選浙江省重點扶植學(xué)科,2005年獲碩士學(xué)位點授予權(quán)。該學(xué)科的主要特色包括分子檢測和檢驗技術(shù)、重大生物安全和生物入侵問題、植物天然活性產(chǎn)物的提取與利用、環(huán)境分子生物學(xué)與農(nóng)產(chǎn)品安全等方面的研究,均從基因或蛋白質(zhì)等方面來闡明具體的機理,這與分子遺傳學(xué)存在著密切聯(lián)系。隨著分子遺傳學(xué)概念的深入人心,為了適應(yīng)培養(yǎng)基礎(chǔ)厚、知識寬、素質(zhì)高、能力強、面向21世紀(jì)開拓創(chuàng)新的生命科學(xué)優(yōu)秀基礎(chǔ)性人才的需要,結(jié)合我院專業(yè)特色和人才培養(yǎng)計劃,2011年新增《分子遺傳學(xué)》課程為本學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)碩士研究生的專業(yè)學(xué)位課,并于2011-2012年第二學(xué)期正式實施教學(xué)工作。
二、教材的選擇和教學(xué)內(nèi)容的整合優(yōu)化
本課程選用了以高等教育出版社出版的由路鐵剛、丁毅主編的《分子遺傳學(xué)》為教材。以南京大學(xué)出版社出版的由孫乃恩,孫東旭,煦編著的《分子遺傳學(xué)》和高等教育出版社出版的由朱玉賢等編著的《現(xiàn)代分子生物學(xué)》等為參考教材,同時也選擇了一些相關(guān)的動畫網(wǎng)絡(luò)電子教材。在教材上突出基礎(chǔ)性、綜合性、前沿性、時代性、創(chuàng)新性和引導(dǎo)性,并且符合相應(yīng)的課時數(shù),同時避免與其它課程的重復(fù),能夠適合應(yīng)用型人才的教材。
同時,從分子遺傳學(xué)的特色出發(fā),優(yōu)化教學(xué)內(nèi)容,注重知識的橫向和縱向銜接,刪改與生物化學(xué)、分子生物學(xué)等相關(guān)課程間重復(fù)交叉內(nèi)容,同時補充本教材內(nèi)容的不足,使教學(xué)內(nèi)容體現(xiàn)課程的特色性。課堂教學(xué)主要是講授基因組學(xué)與后基因組學(xué)、基因組結(jié)構(gòu)與功能、基因表達調(diào)控、基因突變與DNA損傷修復(fù)、遺傳重組與轉(zhuǎn)座、雜交育種與誘變育種、突變體的創(chuàng)制與應(yīng)用、分子遺傳學(xué)研究的常用技術(shù)介紹等。同時在講授基礎(chǔ)知識的同時也結(jié)合相關(guān)前沿?zé)狳c領(lǐng)域的知識和進展,如適當(dāng)引入學(xué)科前沿內(nèi)容以激發(fā)學(xué)生的學(xué)生興趣,并將最新的知識理論和科學(xué)熱點通過文獻介紹給學(xué)生。不僅達到授課內(nèi)容國際化、教學(xué)理念前瞻化,而且可以培養(yǎng)研究生學(xué)習(xí)外文文獻的能力和思考科學(xué)問題的方法和習(xí)慣。教學(xué)過程全部采用多媒體與動畫網(wǎng)絡(luò)資源的教學(xué)方法相結(jié)合。在講授部分內(nèi)容時,注重啟發(fā)研究生尋找自己相關(guān)課題進一步研究的新切入點,引導(dǎo)其通過科研和實驗過程去解決問題。實現(xiàn)在有限的課時中講授分子遺傳學(xué)的新發(fā)展、新觀念,為學(xué)生的思維打開一扇通向未來之門。
三、采用啟發(fā)式、引導(dǎo)式、討論式的教學(xué)方法
研究生教育是我國教育結(jié)構(gòu)中最高層次的教育,培養(yǎng)的研究生不僅要有堅實的理論基礎(chǔ),還要有鮮明的創(chuàng)新性,所以對于這種層次的教學(xué),需要采用多種教學(xué)方式如啟發(fā)式、引導(dǎo)式、討論式。首先,在授課中進行啟發(fā)式教學(xué),引導(dǎo)學(xué)生積極思考,按照提出問題、分析問題、解決問題的思路進行講解,而不是簡單的背記已有的結(jié)論,并在教學(xué)過程中增加專業(yè)英語詞匯,通過課堂上的反復(fù)講授,既能增加學(xué)生的專業(yè)英語詞匯量,幫助學(xué)生更好地理解教材內(nèi)容,又提高了閱讀外文文獻的能力,為將來的專業(yè)及科研工作打下良好的基礎(chǔ)。其次,為了進一步鞏固理論課堂所學(xué)知識,并將理論與將來的研究課題聯(lián)系起來,設(shè)立相關(guān)的討論課,每個學(xué)生以分子遺傳學(xué)技術(shù)結(jié)合自己的研究方向,寫出課題設(shè)計思路,可以是目前正在研究的課題,也可以是假想的課題。讓學(xué)生在課余時間通過文獻查找和整理,準(zhǔn)備討論提綱,并分組討論。鼓勵學(xué)生積極發(fā)言,闡明自己的科研思路,同時教師通過積極正確的引導(dǎo),使課題設(shè)計更加合理,并賦予創(chuàng)新性。最后,進行課堂學(xué)術(shù)報告競賽活動,通過設(shè)計一些學(xué)科發(fā)展前沿與動態(tài)相關(guān)的討論議題,如突變體創(chuàng)制的應(yīng)用前景、轉(zhuǎn)基因作物的安全性等。
四、采用綜合測評的方式評定成績
本課程成績的評定采用綜合測評的方式,進行基礎(chǔ)理論閉卷考試、綜述撰寫和課堂討論表現(xiàn)相結(jié)合的方法,讓研究生通過查閱文獻,撰寫綜述,課堂討論等,鍛煉研究生的歸納總結(jié),推陳出新,開拓創(chuàng)新的綜合能力。也有利于提高研究生的學(xué)習(xí)熱情,并充分調(diào)動研究生主動探究的積極性和主動性。這種考試方法的建立,也增加了對學(xué)生的學(xué)習(xí)情況評價的客觀性,對創(chuàng)新能力培養(yǎng)和教學(xué)評價方式作有益的探索。
綜上所述,本次教學(xué)改革將全面推進研究生的教學(xué)工作,并且使教學(xué)內(nèi)容體現(xiàn)基礎(chǔ)性、綜合性、前沿性、時代性、創(chuàng)新性和引導(dǎo)性。不僅可以有效地提高分子遺傳學(xué)的教學(xué)效果和處理與其它相關(guān)課程的銜接問題,而且還可以增強研究生的自主學(xué)習(xí)、科研創(chuàng)新等能力,讓他們實現(xiàn)科學(xué)知識向技術(shù)的轉(zhuǎn)化,為研究生獨立開展項目研究和申報課題奠定基礎(chǔ),最終產(chǎn)出一定的科研成果,甚至實際的生產(chǎn)力。
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篇4
1.1本科教育忽略學(xué)生實驗技能、邏輯思維和創(chuàng)新能力的培養(yǎng)本科生學(xué)習(xí)模式中老師與學(xué)生基本是零交流,老師幻燈片教授已有現(xiàn)成的書本知識,學(xué)生接受、理解、記憶,完成考試即可。這種方式嚴(yán)重忽略了學(xué)生思考能力和創(chuàng)新力的培養(yǎng),使其缺乏邏輯思維和創(chuàng)新思維的意識習(xí)慣。而學(xué)生在面臨探索型科學(xué)研究時就似隔屋攛椽,無法勝任。
1.2本科教育學(xué)習(xí)環(huán)境簡單,缺乏必需的社交經(jīng)驗醫(yī)學(xué)生的本科學(xué)習(xí)任務(wù)相對其他專業(yè)更加繁重,課業(yè)、考試壓力大,大學(xué)生實踐活動較少,缺乏豐富的人際交往經(jīng)驗。而研究生學(xué)習(xí)環(huán)境相對復(fù)雜,需要處理好與導(dǎo)師、同門、廠家、其他實驗室之間的關(guān)系,存在一定的利益誘惑。一旦進入研究生階段學(xué)習(xí),如何適應(yīng)這種環(huán)境的改變就顯得尤為重要。
1.3研究生生源種類多,知識背景相差大目前研究生招生來源很多,甚至還會有跨專業(yè)報考的現(xiàn)象,所以知識背景相差很大。比如現(xiàn)代的醫(yī)學(xué)科學(xué)研究常常接觸到分子水平的實驗,本科為臨床醫(yī)學(xué)或護理學(xué)的醫(yī)學(xué)研究生比較缺乏。即使本科階段有一些相關(guān)基礎(chǔ)課,由于沒有認識到重要性,知識也比較薄弱;而本科為生物技術(shù)的研究生比其他專業(yè)的學(xué)生掌握更多的分子生物學(xué)背景知識。研究生階段的教學(xué)是以自學(xué)為主,在參差不齊的背景下,如何讓醫(yī)學(xué)研究生迅速學(xué)習(xí)和掌握良好的科研技能,是一個非常重要的問題。
2醫(yī)學(xué)研究生科研技能培養(yǎng)的模式探討
2.1加強本專業(yè)相關(guān)理論知識的積累并進行科研嘗試為彌補本科生理論基礎(chǔ)薄弱的情況,研究生一年級主要是進行理論學(xué)習(xí)以滿足將來的科研要求,如實驗動物學(xué)提供動物實驗的基礎(chǔ)知識,科學(xué)研究嚴(yán)謹(jǐn)?shù)脑O(shè)計和分析需要統(tǒng)計學(xué)。但研究生導(dǎo)師的研究方向很多,對學(xué)生的要求也不一樣,已有的學(xué)校研究生課程無法滿足每個方向的不同要求。為此,重點學(xué)習(xí)相關(guān)專業(yè)的背景知識尤為重要。如對于生殖醫(yī)學(xué)研究方向的研究生,就需要加強生殖醫(yī)學(xué)和生殖生物學(xué)的基礎(chǔ)知識,與其他方向的研究生要求略有不同。為了讓研究生學(xué)習(xí)生殖相關(guān)基礎(chǔ)知識,學(xué)校最近專門開設(shè)了生殖生物學(xué)選修課程,供生殖醫(yī)學(xué)研究方向的研究生選修。現(xiàn)在的醫(yī)學(xué)研究已經(jīng)深入細胞和分子水平,需要用到多種大型儀器。儀器分析課程可以幫助研究生了解常見大型儀器的原理,如用于斷層掃描的激光共聚焦、細胞檢測和分選用的流式細胞儀、超高分辨率的電子顯微鏡等。通過這些理論課程的學(xué)習(xí),研究生可以掌握常見大型儀器的基本原理,有助于將來課題的實驗設(shè)計。以上的努力仍然不能為每個研究方向的研究生開展課題研究提供足夠的理論知識。所以在已有的理論課程的基礎(chǔ)上,通過組織相關(guān)研究方向的研究生深入學(xué)習(xí)專業(yè)相關(guān)的專著就很有意義。如本實驗室從事發(fā)生研究的研究生,就組織學(xué)習(xí)發(fā)生相關(guān)的英文專著,如HistologicalandHistopathologicalE-valuationoftheTestis和Andrology-MaleReproductiveHealthandDysfunction。研究生自學(xué)后以講座的形式,給其他同學(xué)介紹各個章節(jié)的內(nèi)容。通過這種途徑,在學(xué)到專業(yè)知識的同時,提高了自學(xué)能力和英文專著閱讀能力,鍛煉了總結(jié)、陳述、演示以及制作講解報告的能力,有助于開題報告和畢業(yè)答辯的順利完成。
2.2培養(yǎng)良好的實驗技能分子生物學(xué)是從分子水平研究生命現(xiàn)象、生命本質(zhì)、生命活動及其規(guī)律的科學(xué),與其他學(xué)科廣泛交叉滲透,是當(dāng)前生命科學(xué)中迅速發(fā)展的前沿學(xué)科。醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)是實驗性極強的學(xué)科,其實驗技術(shù)和方法已普遍應(yīng)用到各個學(xué)科的研究中。除了分子生物學(xué)技術(shù),其他如細胞生物學(xué)等技術(shù)也在科研中廣泛使用,這些實驗技能的培養(yǎng)對于其課題開展均具有重要的意義。目前研究生數(shù)量多,教育資源有限,即使有實驗課程安排也無法實現(xiàn)讓每個研究生動手操作。所以研究生實驗技能的培養(yǎng)不能僅靠學(xué)校的研究生課程;再者醫(yī)學(xué)研究生一般來自于醫(yī)學(xué)專業(yè)如臨床醫(yī)學(xué)或者護理學(xué)等,本科教育沒有經(jīng)過分子生物學(xué)理論和實踐培訓(xùn),所以研究生進入實驗室后,還需要進一步培訓(xùn)。為此,本實驗室在培養(yǎng)模式上進行了一些嘗試。組織由多位教師、技術(shù)員和高年級博士組成的培訓(xùn)團隊,以專題培訓(xùn)的方式對實驗室基本科研技能進行短期培訓(xùn),包括RT-PCR、蘇木素伊紅染色、免疫熒光、Westernblot、流式細胞術(shù)、顯微鏡操作、文獻檢索等多種常規(guī)實驗方法和技術(shù),目的是讓剛進入實驗室的研究生迅速掌握常用分子生物學(xué)和細胞生物學(xué)技術(shù)以及常規(guī)實驗儀器和設(shè)備的使用。實驗技能培訓(xùn)分為三個部分,首先介紹實
驗的基礎(chǔ)理論,然后演示實驗操作,最后由學(xué)生獨立完成實驗,完成的實驗結(jié)果由老師統(tǒng)一評價。只有能獨立地完成每個實驗,才算順利通過培訓(xùn)。我們深知理論是為了指導(dǎo)實踐,所以理論與實踐齊頭并進的模式能取得更好的效果。在基本理論知識學(xué)習(xí)的過程中,同時進行實踐操作,引導(dǎo)學(xué)生發(fā)現(xiàn)問題并探索思考,形成邊動手邊思考、理論指導(dǎo)實踐的學(xué)習(xí)模式。本實驗室通過這樣統(tǒng)一的理論和實踐相結(jié)合的培訓(xùn),幫助研究生在短時間內(nèi)系統(tǒng)而迅速地掌握常用的基礎(chǔ)實驗理論和技術(shù),為后續(xù)課題開展奠定了堅實的基礎(chǔ),取得了很好的效果。 2.3嚴(yán)格實驗室規(guī)范管理實驗室是高校研究生科研實驗技能培養(yǎng)的主要場所,其建設(shè)和管理水平直接影響研究生科研實驗技能的水平。比如一個實驗室通常有多個研究生,每個研究生在課題開展中一般會使用多種儀器設(shè)備。有的儀器設(shè)備比較貴重,操作不當(dāng)可以導(dǎo)致儀器損壞,甚至威脅人身安全。如高速離心機使用時,轉(zhuǎn)子不蓋蓋子,高速旋轉(zhuǎn)時,轉(zhuǎn)子可以飛出離心機,導(dǎo)致財產(chǎn)或人身損傷。所以如何能保證儀器的正常使用和得到高質(zhì)量的研究數(shù)據(jù),有序的管理就顯得非常重要。以本實驗室為例,實驗過程中會有常見儀器,如pH計、天平等;有貴重儀器,如高速離心機、熒光顯微鏡、定量PCR儀等;還有一些大型的儀器,如電子顯微鏡、流式細胞儀、激光共聚焦顯微鏡等。本實驗室采用如下管理方式:對于實驗室常見儀器,研究生通過培訓(xùn)過后可以自由使用。而大型儀器一般都有分析測試中心集中管理,如電子顯微鏡、流式細胞儀等設(shè)備有工作人員操作,學(xué)生只需理解原理,按照要求準(zhǔn)備樣本和學(xué)會分析數(shù)據(jù)。但有的大型儀器如激光共聚焦,學(xué)生可以通過專門的操作培訓(xùn),自己獨立操作。高速離心機、熒光顯微鏡等設(shè)備一般都有專人管理。在學(xué)生進入實驗室統(tǒng)一培訓(xùn)時,會涵蓋這些設(shè)備的使用。如此,既使得實驗室儀器得到正常使用,又營造了嚴(yán)謹(jǐn)、有序和安全的實驗室環(huán)境,為進行科學(xué)研究提供了必要保證。
篇5
關(guān)鍵詞:生物化學(xué)實驗;瓊脂糖凝膠電泳;教學(xué)體會
中圖分類號:G642.0 文獻標(biāo)志碼:A 文章編號:1674-9324(2014)11-0260-02
瓊脂糖凝膠電泳是核酸分析常用的實驗技術(shù),是核酸研究工作中不可缺少的重要手段,廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)理論研究、農(nóng)業(yè)科學(xué)、醫(yī)學(xué)衛(wèi)生、工業(yè)生產(chǎn)等許多領(lǐng)域,在生物化學(xué)和分子生物學(xué)的教學(xué)和科研中具有重要作用。[1-2]我校自2009年為醫(yī)學(xué)專科學(xué)生增開該實驗以來,受到廣大學(xué)生的歡迎,收到良好的教學(xué)效果。本實驗在實際的操作過程中由于實驗試劑、耗材準(zhǔn)備比較復(fù)雜,微小的疏忽都會導(dǎo)致實驗的失敗,在長期的實驗準(zhǔn)備和教學(xué)過程中,我們總結(jié)了一些教學(xué)經(jīng)驗和教學(xué)體會。
一、實驗前準(zhǔn)備
實驗設(shè)備及材料的準(zhǔn)備。待測DNA,瓊脂糖,電泳儀,電泳槽,紫外透射反射儀,酒精燈,100ml燒杯,微量移液器,三羥甲基氨基甲烷,鹽酸,醋酸鈉,EDTA,瓊脂糖,溴酚藍,溴化乙錠。
二、實驗課中
1.瓊脂糖膠的制備。本實驗配制的是質(zhì)量濃度為1%的50mL凝膠。在電爐上將膠熔至清澈透明的溶液狀,冷卻到60℃左右,加染料GV(GoldView),每100ml膠加5pl,搖勻,倒入事先裝好的水平電泳槽內(nèi),梳子根據(jù)樣品量選用。凝膠厚度一般為0.3~0.5cm。待凝膠完全凝固后(于室溫放置30~45min),在梳子齒附近加入少量電泳緩沖液,然后緩慢輕輕地向上拔掉梳子,將凝膠放入電泳槽中。
2.點樣。點樣量要根據(jù)點樣孔大小和樣品濃度確定,一般上樣體積約5~10uL。點樣前,樣品需按照配比添加上樣緩沖液,吹打均勻后,移液器吸取樣品,垂直于點樣孔,用另一只手幫助固定移液器下端,移液器槍頭尖端進入點樣孔即可將樣品注入孔內(nèi),注意不可將槍頭尖端插至孔底,并選擇其他點樣孔點上適合的DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)(DNA Marker)。所謂適合是指樣品DNA分子量大小應(yīng)基本在DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)范圍之內(nèi)。
3.電泳。將電泳儀的正極與電泳槽的正極相連,負極與負極相連。核酸帶負電荷,從負極向正極移動,膠的點樣孔一端應(yīng)放在電泳槽的負極接線一端。電泳槽中電泳緩沖液與制膠用電泳緩沖液應(yīng)相同,電泳緩沖液(1xTBE),使其恰好沒過膠面約lmm。電泳緩沖液太多則電流加大,凝膠發(fā)熱,設(shè)置好電源,一般采用恒壓電源,電壓選擇為5V/cm左右(長度以兩個電極之間的距離計算)。電泳時間一般為30~60min,根據(jù)實驗需要也可做適當(dāng)調(diào)整。電壓增高,電泳時間縮短,核酸條帶相對來說不夠整齊,不夠清晰;相反,電壓降低,電泳時間較長,核酸條帶整齊清晰。將電泳后的凝膠放在紫外透視儀中觀察結(jié)果,對照DNA marker分析條帶、得出結(jié)論并分析實驗成敗的原因。
4.重視實驗結(jié)果分析,指導(dǎo)填寫實驗報告。生化實驗的目的主要是加強理解和驗證相關(guān)理論,通過實驗操作獲得和提高實驗技能,培養(yǎng)學(xué)生的動手能力。通過實驗結(jié)果分析提高綜合分析的能力,實驗報告在一定程度上起到檢驗學(xué)生對實驗原理、目的、實驗結(jié)果的理解和分析的能力。在過去的實驗報告中,學(xué)生由于不知道如何最終來書寫實驗報告,所以盲目抄書或者相互抄襲的現(xiàn)象很多,實驗結(jié)論往往簡單了事,這樣根本無法達到實驗的預(yù)先效果。有效地利用實驗課后的十分鐘時間給學(xué)生講解如何書寫實驗報告,可以在一定程度上杜絕相互抄襲的現(xiàn)象,既培養(yǎng)學(xué)生養(yǎng)成嚴(yán)謹(jǐn)求實的學(xué)風(fēng)[3-5],又真正地讓學(xué)生在實驗中得到收獲。
三、實驗課后
1.認真批改實驗報告冊,及時返還學(xué)生。在實驗教學(xué)中,教師始終要求學(xué)生在書寫實驗報告時如實反映實驗結(jié)果,不得抄襲或者編寫實驗結(jié)果,這樣教師在批改實驗報告冊時才能更好地發(fā)現(xiàn)實驗失敗或者出現(xiàn)偏差的原因,并在報告冊中一一進行修改;同時,批閱實驗報告冊還能幫助教師發(fā)現(xiàn)一些在以往教學(xué)中容易忽視的問題,對于完善今后的實驗教學(xué)有著深刻的意義。其次,批閱后的報告冊及時返還學(xué)生,可以幫助學(xué)生有效地回憶起實驗中操作不當(dāng)?shù)牡胤骄烤钩霈F(xiàn)在何處,避免在今后的實驗過程中再犯類似的錯誤。
2.課后思考。在參考了其他醫(yī)學(xué)院校的實驗教程,我校瓊脂糖凝膠電泳實驗課的成功開設(shè),是我校生物化學(xué)實驗改革的一大舉措。隨著分子生物學(xué)實驗在醫(yī)學(xué)研究中的地位不斷增強,開展一定比例的生化分子實驗無疑將為學(xué)生今后開展設(shè)計性、綜合性實驗奠定下堅實的基礎(chǔ)[6-11]。
總之,只有不斷總結(jié)經(jīng)驗,探索適合醫(yī)學(xué)專科生物化學(xué)的新實驗,增加學(xué)生學(xué)習(xí)的積極性、主動性,才能培養(yǎng)出面向2l世紀(jì)具有綜合能力和創(chuàng)新意識的高素質(zhì)醫(yī)學(xué)人才。
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篇6
1 生物學(xué)哲學(xué)的再定位
費爾巴哈在談到哲學(xué)的改造時說過:“哲學(xué)必須重新與自然科學(xué)結(jié)合,自然科學(xué)必須重新與哲學(xué)結(jié)合”。這是一種“建立在相互需要和內(nèi)在必然性上面的結(jié)合”。〔1〕自然科學(xué)構(gòu)成了哲學(xué)的基礎(chǔ), 生物科學(xué)是這個基礎(chǔ)中不可或缺的組成部分。如同所有其他科學(xué)一樣,生物科學(xué)也深深受到哲學(xué)的理論思維和方法的影響。生物學(xué)哲學(xué)作為連結(jié)哲學(xué)與生物學(xué)的橋梁和中介,對二者的重新結(jié)合起著十分重要的作用。從學(xué)科建設(shè)的角度看,這門學(xué)科的存在和發(fā)展,既須以實證科學(xué)知識特別是生物科學(xué)的知識材料為基礎(chǔ),跟上現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)發(fā)展的步伐;又要汲取哲學(xué)研究的積極成果,適應(yīng)當(dāng)代哲學(xué)變革的需要。
就學(xué)科性質(zhì)而言,一般認為生物學(xué)哲學(xué)屬于科學(xué)哲學(xué)體系中的一個分支學(xué)科。《大英百科全書》第15版所列《自然哲學(xué)》條目將關(guān)于自然的實際特征問題作為實在來進行考察,并分為物理學(xué)哲學(xué)和生物學(xué)哲學(xué)兩個部門。不過這里對“自然哲學(xué)”一詞的使用,有別于以往的傳統(tǒng)自然哲學(xué),而是“作為對科學(xué)哲學(xué)的補充”。如所周知,西方科學(xué)哲學(xué)是以科學(xué)為研究對象,主要論述科學(xué)的認識論和方法論問題。維也納學(xué)派的創(chuàng)立者M.石里克的自然哲學(xué)也是作為一種科學(xué)哲學(xué),一種探討哲理的科學(xué)方法。他申明自然哲學(xué)的任務(wù)在于解釋自然科學(xué)命題的意義,自然哲學(xué)是一種旨在考察自然定律的意義的活動。在其自然哲學(xué)講稿中關(guān)于生物哲學(xué)的分析,便是從有機自然現(xiàn)象也一定要由定律來描述這一點出發(fā),來討論生物學(xué)中的機械論與活力論問題。
在科學(xué)哲學(xué)的發(fā)展進程中,除了一般科學(xué)哲學(xué),還興起了特定學(xué)科的科學(xué)哲學(xué),自本世紀(jì)初以來主要是物理科學(xué)哲學(xué)。傳統(tǒng)的科學(xué)哲學(xué)帶有片面的物理主義傾向,認為運用物理方法能夠?qū)@個世界作出絕對完全的描述,世界上發(fā)生的每一事件均可用物理語言來描述。物理主義最熱烈的倡導(dǎo)者、分析哲學(xué)的主要代表人物之一的R.卡爾納普聲言:“如果根據(jù)物理語言的普遍性,把物理語言用作科學(xué)的系統(tǒng)語言,那么,所有的科學(xué)都會成為物理學(xué)。……實際上只有一種客體,那就是物理事件。在這物理事件范圍內(nèi),規(guī)律是無所不包的”。〔2 〕石里克也同意物理主義的觀點,他僅僅基于量的方面的考慮而得出結(jié)論:“對于自然哲學(xué)而言,有機體不過就是一些特殊的具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)的系統(tǒng),它們被包含在物理世界圖像的完美和諧的秩序之中”。〔3〕
傳統(tǒng)的科學(xué)哲學(xué)把研究重點放在物理學(xué)的定律和理論上,把它們看作科學(xué)的結(jié)構(gòu)和邏輯的范例。之所以這樣是有其深遠的科學(xué)背景的。自牛頓實現(xiàn)了力學(xué)中第一次偉大綜合,此后,經(jīng)典物理學(xué)的各個分支日趨完善,牛頓的機械綱領(lǐng)左右了近代科學(xué)和哲學(xué)的發(fā)展。本世紀(jì)初以相對論和量子力學(xué)的建立為標(biāo)志的物理學(xué)革命,是物理學(xué)發(fā)展中的重大突破,也是對科學(xué)哲學(xué)的有力推動。邏輯經(jīng)驗主義的主要代表H.萊辛巴赫所著《量子力學(xué)的哲學(xué)基礎(chǔ)》一書,就是通過對量子力學(xué)的科學(xué)成果的分析,闡釋了他關(guān)于知識的性質(zhì)、客觀實在以及因果性等問題的見解。多年來,科學(xué)哲學(xué)的研究植根于邏輯學(xué)、數(shù)學(xué)及物理學(xué)定律,重視對物理理論的分析而忽略了生物學(xué)。正如在科學(xué)哲學(xué)家的視野內(nèi),有機生命及其進化只不過是世界科學(xué)圖景中的一個次要因素;在科學(xué)哲學(xué)的殿堂中,生物學(xué)哲學(xué)也是處于比較次要的從屬的地位。這種狀況只是到本世紀(jì)中葉以后才開始改觀。隨著分子生物學(xué)所取得一系列新進展,導(dǎo)致了生物學(xué)的革命,生命科學(xué)作為最激動人心的科學(xué)領(lǐng)域躍居到自然科學(xué)的前沿,對現(xiàn)代整個自然科學(xué)和哲學(xué)的影響也日益顯著。由于引入數(shù)學(xué)、物理、化學(xué)等學(xué)科的理論、方法和新的技術(shù)手段,現(xiàn)代生物學(xué)的研究領(lǐng)域得以向微觀和宏觀層次不斷延伸擴大,并愈來愈趨向系統(tǒng)的復(fù)雜性,向揭開物質(zhì)世界最復(fù)雜最高級的系統(tǒng)——大腦的奧秘進軍。生物學(xué)研究的課題愈來愈帶有根本性,當(dāng)今自然科學(xué)的研究重點正在轉(zhuǎn)向研究生命本身。對生命現(xiàn)象的深入探索,增強了人們對生物學(xué)的哲學(xué)興趣,并促使科學(xué)哲學(xué)向新的研究方向轉(zhuǎn)變。在這方面,現(xiàn)代綜合進化論的主要建筑師之一E.邁爾作出了開創(chuàng)性的工作,他致力于建立生物學(xué)的新哲學(xué),強調(diào)這樣一種新的科學(xué)哲學(xué)必須放棄對僵化的本質(zhì)論和決定論的依附,必須將科學(xué)概念加以擴展、不僅包括物理科學(xué)的而且還包括生物科學(xué)的原理和概念。
傳統(tǒng)科學(xué)哲學(xué)還帶有專注于純科學(xué)領(lǐng)域的局限。國外學(xué)術(shù)界在討論醫(yī)學(xué)哲學(xué)與科學(xué)哲學(xué)的關(guān)系這一論題時,已有學(xué)者指出,從歷史上看,科學(xué)哲學(xué)家往往不到自然科學(xué)領(lǐng)域外面去尋找對科學(xué)的定律、解釋和理論的洞察力以確定理論演變的進程,而是將自己限制于純科學(xué)形式中,一直忽視和輕視象工程學(xué)、農(nóng)學(xué)和醫(yī)學(xué)這樣的應(yīng)用科學(xué)領(lǐng)域。同時由于傳統(tǒng)科學(xué)哲學(xué)僅僅局限于從“內(nèi)部”考察科學(xué),忽視了科學(xué)技術(shù)與社會之間的互動關(guān)系,這種狹窄的科學(xué)觀不可能得出真正有洞察力的答案。傳統(tǒng)科學(xué)哲學(xué)在研究視野上的這些缺陷,對后來興起的生物學(xué)哲學(xué)也產(chǎn)生了某種程度的影響。
固然,科學(xué)哲學(xué)主要是把科學(xué)作為知識體系,對之進行認識論和方法論的研究,但是認識的最終目的不是知識本身,而是改造世界的實踐活動。對科學(xué)的哲學(xué)反思也不能脫離它所固有的實踐本性。在科學(xué)、技術(shù)和社會走向一體化的現(xiàn)時代,尤有必要拓寬科學(xué)哲學(xué)的領(lǐng)域,開展實用性的或應(yīng)用性的研究,并將科學(xué)哲學(xué)研究同科技發(fā)展的社會研究結(jié)合起來。作為實用科學(xué)的農(nóng)學(xué)和醫(yī)學(xué)與作為基礎(chǔ)科學(xué)的生物學(xué)之間的聯(lián)系極其密切,它們都屬于生命科學(xué)的范疇。在生命科學(xué)哲學(xué)領(lǐng)域內(nèi),理應(yīng)包括對這些應(yīng)用學(xué)科的理論和實踐的哲學(xué)研究。以分子生物學(xué)為依托的生物技術(shù),將成為醫(yī)學(xué)和農(nóng)業(yè)科學(xué)的主導(dǎo)技術(shù),并將引起醫(yī)學(xué)革命和第三次農(nóng)業(yè)革命。生物技術(shù)的“每一個創(chuàng)新,每一個技術(shù)妙舉,每一個概念上的困難的解決,都使得需要一種確定的生物學(xué)哲學(xué)變得更加顯著,并且目前正在朝向這個目標(biāo)發(fā)展”。〔4〕
21世紀(jì)將是生物學(xué)世紀(jì)。可以預(yù)期,未來世紀(jì)生命科學(xué)的巨大進展及其革命性變化,必然要求生物學(xué)哲學(xué)在已有研究基礎(chǔ)上,無論從理論框架到研究內(nèi)容到論題范圍都要有所突破。要盡力吸收、消化生命科學(xué)的最新成就,以正確的世界觀和方法論為指導(dǎo)作出新的哲學(xué)概括,提出新的理論觀點及發(fā)展生物科學(xué)技術(shù)的戰(zhàn)略選擇,這些可謂生物學(xué)哲學(xué)學(xué)科建設(shè)的題中應(yīng)有之義。
2 拓展和深化生物學(xué)發(fā)展新形勢下的生物學(xué)哲學(xué)研究
以下試從生物科學(xué)發(fā)展的規(guī)律性、生物學(xué)規(guī)律與物理規(guī)律的關(guān)系以及生物學(xué)規(guī)律與社會規(guī)律的關(guān)系三方面談點淺見。
(1)“自然科學(xué)現(xiàn)在已發(fā)展到如此程度, 以致它再也不能逃避辯證的綜合了”。〔5〕恩格斯在上個世紀(jì)80年代作出的這一論斷, 揭示了辯證思維對于了解科學(xué)事實的辯證性質(zhì)的必要性,這也為后來自然科學(xué)本身的發(fā)展所證實。
近現(xiàn)代自然科學(xué)發(fā)展的趨勢是由經(jīng)驗分析進到辯證綜合,這在生物學(xué)的發(fā)展中表現(xiàn)得十分明顯。自本世紀(jì)二、三十年代起,在生物學(xué)范圍內(nèi)開始出現(xiàn)一些學(xué)科的綜合趨勢。早期的兩大綜合,一個是以胚胎學(xué)為中心,將之與細胞學(xué)、遺傳學(xué)和生物化學(xué)綜合起來,形成統(tǒng)一的發(fā)育觀點;另一個是以進化論為中心,將達爾文的自然選擇學(xué)說與群體遺傳學(xué)相結(jié)合,發(fā)展為一個有巨大闡明力的學(xué)說,即現(xiàn)代綜合進化論。進化的綜合范式取得了富有建設(shè)性的成果,如邁爾所說,是在有關(guān)的學(xué)科之間找到了一種共同語言并澄清了許多進化問題和作為其基礎(chǔ)的各種概念。但是這一范式仍是不完善的,還有不少尚未解決的問題。它不僅受到一些批評家的非難和質(zhì)疑,就是在達爾文主義者之間也依然存在某些意見分歧。更完全的綜合始于本世紀(jì)50年代中后期誕生的分子生物學(xué),它是生物化學(xué)、微生物學(xué)和遺傳學(xué)等學(xué)科相互融合的產(chǎn)物,其主要目標(biāo)之一是試圖將大量的生物功能與分子水平上發(fā)生的事件聯(lián)系起來。分子生物學(xué)的核心——分子遺傳學(xué),在信息大分子的結(jié)構(gòu)、功能及相互關(guān)系的基礎(chǔ)上來研究生物的遺傳與變異。按照生物學(xué)史家G.E.艾倫的說法,J.沃森和F.克里克的工作,把信息學(xué)派、結(jié)構(gòu)學(xué)派和生化學(xué)派對遺傳(甚至擴展到整個生物學(xué))的問題的研究統(tǒng)一起來了。作為一個新的遺傳學(xué)范式,分子遺傳學(xué)的范式補充和修正了(不是取代)進化綜合范式,推動了關(guān)于進化過程中基因的變化和調(diào)節(jié)機制等問題的研究。著眼于分子水平上的進化的中性學(xué)說同著眼于表型進化的自然選擇學(xué)說,也應(yīng)看作是一種互補關(guān)系而非互相否定。現(xiàn)代分子生物學(xué)在進化研究方面的認識成果向人們昭示,一種完整的進化理論的建立,期待著傳統(tǒng)的進化生物學(xué)與分子生物學(xué)實現(xiàn)新的綜合。更進一步看,生物進化是種系發(fā)生和個體發(fā)育的辯證統(tǒng)一過程,對進化的深層認識,必須解開發(fā)育之謎這個世紀(jì)難題,以闡明個體發(fā)育中基因在多層次水平上的程序控制機理。由于分子生物學(xué)、細胞生物學(xué)與遺傳學(xué)的結(jié)合,把發(fā)育生物學(xué)推向前臺,將成為21世紀(jì)生命科學(xué)的新主角。據(jù)中科院未來生物學(xué)預(yù)測研究組預(yù)測,在分子水平上使遺傳、發(fā)育和進化的統(tǒng)一成為可能,這將是未來生物學(xué)的主要理論任務(wù)之一。由這三者統(tǒng)一所導(dǎo)致的理論大綜合,蘊含著豐富的哲學(xué)思想。從哲學(xué)認識論和方法論上對之進行理論概括,也應(yīng)成為未來生物學(xué)哲學(xué)的主要理論任務(wù)之一。
“分久必合”。生物學(xué)中的這種綜合趨勢還在繼續(xù)。一些生物學(xué)家預(yù)言,面向21世紀(jì)的生命科學(xué),必然是各學(xué)科相互滲透與相互交融的“大生物學(xué)”時代。“大生物學(xué)”要求辯證地綜合與不同組織水平相關(guān)的各門學(xué)科所積累的科學(xué)事實,建立起一般的生命理論,發(fā)展統(tǒng)一的生物學(xué)原理。多種學(xué)科的綜合,反映了生物現(xiàn)象的相互聯(lián)系和科學(xué)概念、方法論準(zhǔn)則的統(tǒng)一。結(jié)合生物學(xué)認識發(fā)展的內(nèi)在邏輯的考察,對生物學(xué)理論的相互關(guān)系(特別是理論的概念結(jié)構(gòu)之間的轉(zhuǎn)換、理論范式的確立和更替)進行哲學(xué)分析,能為我們提供有關(guān)生物科學(xué)發(fā)展規(guī)律性的新的認識。
(2)在生物學(xué)哲學(xué)的討論中, 爭議較多而且也是懸而未決的一個理論問題是關(guān)于生物學(xué)的自主性問題。具體言之,生物學(xué)的概念與規(guī)律能否在某種意義上“還原”為物理學(xué)和化學(xué)的概念與規(guī)律?生物學(xué)家運用的解釋型式(例如歷史的解釋或目的論的解釋)在物理科學(xué)中是否相宜?在生物系統(tǒng)中顯示的某些現(xiàn)象是否也在無機系統(tǒng)中顯現(xiàn)或有重大差異?等等這樣一些有關(guān)生物學(xué)和物理學(xué)的聯(lián)系究竟是什么的問題, 被A. 羅森伯格稱之為“生物學(xué)哲學(xué)的中心問題”(《生物科學(xué)的結(jié)構(gòu)》)。根據(jù)對這個問題的不同回答而形成了“自主論”與“分支論”兩派涇渭分明的理論觀點。這種分野在歷史上的表現(xiàn)形式是活力論與機械論的對立,在現(xiàn)代則主要是所謂反還原論與還原論的爭論。
從本體論方面說,討論物理化學(xué)的實體和過程是否構(gòu)成所有生命現(xiàn)象的基礎(chǔ),這實質(zhì)上就是高級運動形式與低級運動形式的相互關(guān)系問題。如果把生命運動形式同物理化學(xué)的運動形式混同起來,甚至完全否定生命運動在質(zhì)上的特殊性,這種本體論上的極端還原論傾向在哲學(xué)上和生物學(xué)上都是不可取的。相反,如果把生命運動的獨特性絕對化,忽視其與其他運動形式之間的包容關(guān)系和發(fā)生學(xué)聯(lián)系,這種傾向同樣是不可取的。以辯證唯物主義的物質(zhì)運動形式觀為指南,依據(jù)科學(xué)認識的新成果,將能通過闡明生命運動和低級運動形式存在的聯(lián)系和連續(xù)性而更深入地揭示其本質(zhì)。
從方法論方面說,在生物學(xué)中通過把復(fù)雜現(xiàn)象分解為更為簡單的組成部分進行研究,最終在物理化學(xué)層次上——分子層次上——作出說明,這也即還原論作為方法論的功能。分子生物學(xué)正是運用物理化學(xué)的還原方法來分析生命活動的基本過程,才獲得了劃時代的成就。這被譽為還原論的勝利。但是也要看到,生物學(xué)中還原方法的應(yīng)用是有其局限性的。研究表明,生物體是一個多層次的、有組織的、結(jié)構(gòu)復(fù)雜的系統(tǒng),其中各個組成部分和整體具有多方面的相互作用。生物體的整體性不能建筑在來自于各個部分的分子碎片之上,分子參與組織的整體,它們的轉(zhuǎn)移和復(fù)制是整體的全部功能的結(jié)果。本世紀(jì)下半葉以來系統(tǒng)科學(xué)和非線性科學(xué)的發(fā)展,為探索生命系統(tǒng)的復(fù)雜性提供了新的科學(xué)思想和科學(xué)方法。還原論方式的自下而上的決定原則即較低層次決定較高層次的原則,同系統(tǒng)整體思維方式的自上而下的決定原則即較高層次決定較低層次的原則,二者既相互對立又相互依賴,它反映了部分與整體的辯證法。合理地結(jié)合這兩種決定原則,應(yīng)是生物學(xué)進一步闡明生命機制及其規(guī)律性的研究戰(zhàn)略。
(3)在當(dāng)代, 從自然科學(xué)奔向社會科學(xué)的強大潮流已成為不可遏止之勢。由于生物學(xué)革命對自然和人類社會生活產(chǎn)生的廣泛影響,凸顯了人的自然基礎(chǔ)和社會基礎(chǔ)的統(tǒng)一問題。與此相應(yīng),生物科學(xué)和社會科學(xué)的綜合性研究也成為人們關(guān)注的熱點。加拿大哲學(xué)家M.魯斯在其《生物學(xué)哲學(xué)》一書中宣稱,未來的社會科學(xué)將和生物學(xué)結(jié)合起來,社會學(xué)將把生物學(xué)的成果包括在自己的理論中,研究這種結(jié)合會提供許多有意義的東西。從現(xiàn)代生物學(xué)的發(fā)展可以看到,生物科學(xué)領(lǐng)域的一些學(xué)科(如遺傳學(xué)、動物行為學(xué)、生態(tài)學(xué)等)與社會學(xué)、人類學(xué)、倫理學(xué)、經(jīng)濟學(xué)及政治學(xué)等學(xué)科的滲透、融合,不僅加深了人們對自然界和人類自身的認識,同時也啟迪了對生物學(xué)規(guī)律和社會規(guī)律二者相互關(guān)系的哲學(xué)思考。如生態(tài)經(jīng)濟學(xué)作為生態(tài)學(xué)與經(jīng)濟學(xué)交叉發(fā)展起來的一門邊緣學(xué)科,主要是闡明生態(tài)系統(tǒng)與經(jīng)濟系統(tǒng)相互作用所形成的生態(tài)經(jīng)濟系統(tǒng)運動和發(fā)展的客觀規(guī)律。而生物政治學(xué)則旨在用生物學(xué)的概念、原理和方法來研究政治行為,借以探索社會政治生活的本質(zhì)及其規(guī)律。在橫跨生物科學(xué)與社會科學(xué)的眾多交叉學(xué)科中,1975年由美國動物學(xué)家E.威爾遜在其巨著《社會生物學(xué):新的綜合》中所倡導(dǎo)并加以重新解釋的社會生物學(xué)引起了很大反響。這是一門系統(tǒng)研究一切動物(包括人類在內(nèi))的社會行為的生物學(xué)基礎(chǔ)的學(xué)科,其核心在于承認基因是遺傳和自然選擇的基本單位,一切社會行為均有其特殊的遺傳結(jié)構(gòu)。威爾遜和C.拉姆斯登還進行了更為廣泛的概括,在他們所著《基因、理性和變化》(1981)中提出基因—文化互作進化論,認為整個人類文化領(lǐng)域在一定程度上依賴于遺傳控制。學(xué)術(shù)界對社會生物學(xué)褒貶不一,圍繞它所提出的人類行為的遺傳決定問題展開了激烈的爭論。這場爭論遠未完結(jié),它所涉及的生物進化與文化進化的關(guān)系、社會生物學(xué)的哲學(xué)意義以及如何正確評價這一學(xué)說等問題也是生物學(xué)哲學(xué)研究的課題。
生物學(xué)與社會相互作用的一個引人注目的方面,表現(xiàn)為生物技術(shù)研究對倫理觀的沖擊和基因工程的社會控制及其倫理調(diào)節(jié)。生命科學(xué)技術(shù)的進步,在造福人類的同時也引發(fā)出許多社會倫理問題,向傳統(tǒng)的倫理道德觀念提出了新的挑戰(zhàn)。舉醫(yī)學(xué)領(lǐng)域來說,由于醫(yī)學(xué)技術(shù)以人作為直接作用對象,它所引發(fā)的倫理問題更為突出。自本世紀(jì)六、七十年代以來,國外醫(yī)學(xué)界關(guān)于死亡標(biāo)準(zhǔn)、器官移植、安樂死、重組DNA 技術(shù)以及人工生育技術(shù)種種問題的倫理學(xué)爭論,無不反映了傳統(tǒng)倫理觀的困惑和人類面臨的倫理學(xué)上的選擇。在當(dāng)代新科技革命條件下,隨著生物高技術(shù)的發(fā)展,不斷涌現(xiàn)出新的倫理道德難題。被稱為生物學(xué)領(lǐng)域的第一“大科學(xué)”的人類基因組工程,無疑會深化人類對自身結(jié)構(gòu)的認識,但這項研究也將面臨與倫理觀念相悖的嚴(yán)峻形勢。例如,由檢測基因產(chǎn)生的侵犯個人健康隱私權(quán)問題。當(dāng)今在世界范圍內(nèi)受到廣泛關(guān)注的克隆綿羊“多利”的出世,更是激起了一場有關(guān)其應(yīng)用前景和倫理意義的大爭論。人能否克隆?在人身上重現(xiàn)這一成就或者創(chuàng)造新的生命形式(如人獸混合體)是否合乎倫理?未來的生命科學(xué)技術(shù)怎樣與社會協(xié)調(diào)?是否應(yīng)該著手進行人種改造的選擇?站在生物學(xué)哲學(xué)的高度,我們將如何回答這些問題?
參考文獻
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[2]洪謙主編:《邏輯經(jīng)驗主義》,下卷,商務(wù)印書館,1984, 第476頁。
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[4]金吾侖選編:《自然觀與科學(xué)觀》,知識出版社,1985, 第30頁。
篇7
獎學(xué)金類型
相信絕大多數(shù)申請人都比較清楚地知道美國大學(xué)可申請的獎學(xué)金種類和一般條件,這里只針對專業(yè)類型進行簡單說明:
(1)Fellowship
大家常說的“純獎學(xué)金”類型。所謂純獎學(xué)金,就是非服務(wù)性的資助。也是獎學(xué)金當(dāng)中拿著最為舒服的一種,不用干活就可以拿的錢。此類資助通常不受專業(yè)限制,且數(shù)額較高,但是相應(yīng)的名額很少,所以競爭都超常激烈。如果不是各項條件都非常優(yōu)秀,想拿此類獎學(xué)金非常困難,但是在做網(wǎng)申的時候申請這類獎學(xué)金是我們的權(quán)利,因此看見后不要多想――肯定申請。
(2)Scholarship
另外一種形式的“純獎學(xué)金”類型。此類資助同樣不受專業(yè)限制,種類繁多,某些學(xué)校甚至有幾十種針對本土和國際學(xué)生的此類資助。但數(shù)額沒有Fellowship那么高,大陸地區(qū)申請者拿到幾千美金或是按州內(nèi)學(xué)生收費,抵銷學(xué)費/學(xué)分的居多。如果拿到這類的獎學(xué)金,申請人們最好馬上確認該項獎學(xué)金的額度,了解和全額獎學(xué)金還有多大差距,防止I20都收到了才發(fā)覺不是全獎。
(3)Tuition-Waiver
部分或全部減免學(xué)費是眾多大陸地區(qū)申請者,尤其非理工類申請者拿到最多的一種資助類型。減免學(xué)費類的資助屬于非服務(wù)類資助中發(fā)放最多,最容易申請的一類。順便說一句,網(wǎng)上很多人不知道全獎、半獎如何區(qū)分,大家如果獲得全部減免學(xué)費就屬于半獎的類型,如果在此基礎(chǔ)上有TA、RA之類,那么通常就是全獎了(足夠Cover整個學(xué)習(xí)期間的費用了)。
(4)RA and TA
RA、TA顧名思義,就是助研和助教,這兩類助學(xué)金是國內(nèi)申請者,尤其是理工類申請者拿到最多的兩種類型的獎學(xué)金。RA、TA對于美國研究生或以上級別的申請來說占大多數(shù)。通常大陸地區(qū)申請者拿到RA、TA后會附帶全免學(xué)費,就是通常意義上的全獎了。
獎學(xué)金的變化和誤區(qū)
對于獎學(xué)金類型有了基本了解之后,再談?wù)劥蠹腋鼮殛P(guān)心的近年美國各專業(yè)申請中獎學(xué)金發(fā)放的一些變化和誤區(qū),很多網(wǎng)上的信息已經(jīng)失去實效性了,如果大家還拿著那些信息來做申請,必然會受到非常大的誤導(dǎo)和影響,甚至完全的失敗。
(1)盲目認為PHD意味著全獎Offer
這是在中國大陸地區(qū)申請者中普遍存在的一種誤區(qū),不論專業(yè),不管Program類型和特性,一律以PHD申請為先。不圖別的,為的就是全獎。事實上從近幾年的申請中我們可以看到,除了數(shù)學(xué)、化學(xué)、物理幾個基礎(chǔ)中的基礎(chǔ)學(xué)科外,其它類型課程的錄取趨勢和獎學(xué)金情況,都與以前發(fā)生了不同程度上的變化。拿經(jīng)濟類申請舉例,以前大家只知道農(nóng)業(yè)經(jīng)濟和計量經(jīng)濟類的理論性經(jīng)濟學(xué)PHD課程有全獎,所以打破頭似的無一例外地主申這種研究方向。事實上,近兩到三年,一些實用性的經(jīng)濟或金融課程的獎學(xué)金也有了很大幅度的提升,類似與區(qū)域經(jīng)濟或反傾銷有關(guān)的經(jīng)濟類研究方向和金融課程,都有全額獎學(xué)金出現(xiàn)。包括一些如電子信息工程、計算機一類的理工科課程,Master的全獎也不占少數(shù)。
除此之外,隨著中國大陸學(xué)生赴美人數(shù)的增加,客觀來講可以說是良莠不齊,有些夸大了自己的背景和條件,但到校之后被學(xué)校發(fā)現(xiàn)名不副實。因此有些大學(xué)基于此類教訓(xùn),逐漸開始對于PHD錄取學(xué)生采取先觀察再發(fā)獎的策略,就是你條件再好前期學(xué)校也只給你錄取,等到學(xué)校通過Qualification Exam之后才能發(fā)放全額獎學(xué)金,極大地避免那些濫竽充數(shù)的申請人混跡其中。
(2)生物類、臨床類背景申請者必選分子/細胞生物學(xué)
不知道是不是受到網(wǎng)上一些所謂申請經(jīng)驗總結(jié)的影響,很多有生物類或醫(yī)學(xué)類背景的申請者在選擇時都會偏重分子生物學(xué)、細胞生物學(xué)、生物化學(xué)一類基礎(chǔ)研究方向。基礎(chǔ)性研究獎學(xué)金相對更多是不假,生物化學(xué)每年是發(fā)全獎最多的生物類研究方向也不錯,不過分子生物學(xué)、細胞生物學(xué)等幾個研究方向近兩年的錄取比率和全獎發(fā)放已經(jīng)不像大家早期獲得的那樣了。反而神經(jīng)系統(tǒng)類、遺傳類、生物工程相關(guān)專業(yè),或研究方向的獎學(xué)金情況已經(jīng)有了大幅度的提升。包括發(fā)放給大陸地區(qū)申請者的GA和Fellow數(shù)量都相當(dāng)可觀。
(3)MBA等商科注定要純自費
對于這類大家認為的“高投入高產(chǎn)出”專業(yè),很多人之前都不敢奢望獲得獎學(xué)金。不過從近兩年國內(nèi)申請者獲得的結(jié)果來看,商科全獎、3/4獎等大量涌現(xiàn),給了很多人“在夢境”的感覺,我就跟一個2006年拿Rice MBA 3/4獎的申請者進行過溝通,在他看來,獲得錄取后與學(xué)校積極主動溝通和聯(lián)系,或者憑借自己的優(yōu)異背景或硬件成績拿到半獎以上的商科錄取是近一兩年很常見的情況。不要認為排名比較高的學(xué)校就不會給獎學(xué)金,這些學(xué)校給獎學(xué)金反而更為大方,關(guān)鍵是看你怎么處理自己的申請。
(4)本科的LAC一定會有全獎
隨著對于美國留學(xué)申請認識的提高,但又不是完全客觀的認識,很多家長都有了這樣一種想法――去美國讀本科既可以享受到優(yōu)質(zhì)的本科教育,同時還能拿高額的獎學(xué)金。但是隨著申請的人越來越多,人們也逐漸認識到不是所有美國的University都提供全獎,這時一個新的概念又出現(xiàn)在人們的視線當(dāng)中:LAC。確實,從給錄取學(xué)生的獎學(xué)金比例和額度上,LAC的學(xué)校是要比University給的多一些,但也不是每所學(xué)校都會給全獎,因此把去美國讀本科和拿全獎等同起來也是一個對于獎學(xué)金認識的重大誤區(qū),如果希望自己獲得全獎讀本科,那么之前一定要了解學(xué)校的獎學(xué)金政策,看這個學(xué)校的獎學(xué)金設(shè)置情況,是Need Based還是Need Blind,當(dāng)然有一些學(xué)校是錄取后就給全獎,但是申請這樣的學(xué)校競爭是極為慘烈的,而且是眾多美國大學(xué)中的鳳毛麟角,想要獲得那樣的大學(xué)錄取,不付出超出常人的努力和成績是無法得到的。一般的University是會提供給優(yōu)秀的錄取學(xué)生一定的Scholarship,數(shù)額從幾千美金到兩萬美金不等,根據(jù)學(xué)校具體的獎學(xué)金政策而定。
2004-2007年期間獎學(xué)金發(fā)放有不同程度提升的專業(yè)如下:
(1)提升幅度最大:經(jīng)濟、金融類Master、MBA、會計、MPA等。
(2)提升幅度較大:遺傳、生物類、計算機、電子信息工程、機械工程類Master、國際經(jīng)濟金融、工程管理等。
篇8
關(guān)鍵詞:生物醫(yī)學(xué);發(fā)展趨勢;特征
0前言
隨著社會經(jīng)濟的發(fā)展,生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域不斷取得新突破,對人們的生活產(chǎn)生巨大影響,人們對生命科學(xué)本質(zhì)的認識也更加深入,對于疾病的研究不再停留在表層,而是深入到了分子,并通過理論與試驗結(jié)合研究出更多治療方法,對于人類身體健康發(fā)展產(chǎn)生了重要影響。
1生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展趨勢
1.1實現(xiàn)生命操控的趨勢
生命操控的理論基礎(chǔ)是合成生物學(xué),就是要對一些生命體系進行有目的性的設(shè)計,是其能夠滿足人們需要,或者是為人類提供新的食物及藥物,或者能夠制造出一些新型環(huán)保材料,或者能夠幫助人們處理某些信息,這一學(xué)科結(jié)合了包括基因工作、納米技術(shù)以及計算機模擬等多個領(lǐng)域的技術(shù),對于解決人類身體健康問題、環(huán)境污染問題等具有非常重要的作用,這種將這種對生命過程進行重新設(shè)計的研究方法稱之為生命操控,體現(xiàn)出人類對生命體的研究已經(jīng)逐漸從分散走向系統(tǒng),人工細胞得合成就是生命操控的成功實例,也就是說人類已經(jīng)不僅可以在分子水平觀察生命,還能夠通過技術(shù)手段再造生命、操控生命[1]。
1.2基因藥物迅速發(fā)展
藥物是解除人類身體疾病的重要物質(zhì),對人體致病原因的研究越深入,人們就越有機會研制出更先進的藥物來治療這些疾病。隨著生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展,人們對致病原因的研究已經(jīng)深入到了基因水平,在發(fā)現(xiàn)各類致病基因及其致病機理以后,人們對藥物的研究也突破了傳統(tǒng)領(lǐng)域,不再是對所有細胞或者基因展開攻擊,而是對致病基因進行選擇性的攻擊,這樣不僅能夠大大提升藥物療效,還能夠降低這些藥物對人體產(chǎn)生的副作用,這種單一基因?qū)?yīng)單種藥物的研究方式已經(jīng)取得了顯著成果,但是值得注意的是,在面對單一基因開發(fā)藥物時一定要對整個網(wǎng)絡(luò)進行控制,否則就可能達不到預(yù)期臨床效果,或者是產(chǎn)生其他副作用。
1.3對于一些復(fù)雜性疾病進行深入研究
心腦血管類疾病以及腫瘤等一直是困擾人類身體健康的難題,造成這些疾病的原因很復(fù)雜,由于其并不是某個基因缺陷引起的,而是綜合了多種遺傳因素與環(huán)境因素,因此要想治愈這些疾病還有很長的路要走。生物醫(yī)學(xué)還不發(fā)達的時代,人們對這些復(fù)雜性疾病的研究具有一定的片面性,研究方法也比較單一,防治模式也比較簡單,治療水平無法滿足實際需要。實際上人體內(nèi)部存在一個復(fù)雜的運行網(wǎng)絡(luò),無論是某種物質(zhì)的通道還是某種調(diào)節(jié)作用,都是一個個小體系,各個小體系之間又會相互影響,因此這些復(fù)雜疾病是所有體系共同作用的結(jié)果,近幾年人們通過生物學(xué)方法對這些體系進行深入研究,往往以更加系統(tǒng)、綜合的角度來看待這些疾病,雖然要真正找到治療和預(yù)防這些疾病的方法還需要一定時間,但是我們不得不說已經(jīng)找到了正確的研究方向[2]。
2當(dāng)前生物醫(yī)學(xué)發(fā)展特征分析
2.1各個學(xué)科之間走向聚合
生物醫(yī)學(xué)的迅速發(fā)展實際上是多門學(xué)科結(jié)合在一起的結(jié)果,學(xué)科之間的交叉對新興學(xué)科的發(fā)展具有重要意義。例如,分子生物學(xué)領(lǐng)域得出了基因是遺傳物質(zhì)這一結(jié)論,之后人們根據(jù)這一結(jié)論分析出了基因調(diào)控以及表達過程,從此對基因的研究進入了新階段,而分析這一結(jié)論的得出過程我們不難發(fā)現(xiàn),其基礎(chǔ)并不是生物這一門學(xué)科,而是結(jié)合了傳統(tǒng)生物學(xué)知識、化學(xué)知識以及物理知識,也就是說這些學(xué)科的交叉促進了分子生物學(xué)的發(fā)展,再比如,現(xiàn)代分子影像技術(shù)就是醫(yī)學(xué)理論與物理技術(shù)結(jié)合的結(jié)果。而隨著生物醫(yī)學(xué)的進一步發(fā)展,這種交叉模式已經(jīng)逐漸向著聚合模式轉(zhuǎn)變,這種模式除了涉及到醫(yī)學(xué)技術(shù)、生物學(xué)技術(shù)以外,還囊括了納米技術(shù)以及計算機技術(shù),這些技術(shù)在推動生物醫(yī)學(xué)發(fā)展的過程中體現(xiàn)出一種聚合性,體現(xiàn)出了生物醫(yī)學(xué)發(fā)展的巨大潛力,不就的將來一定會產(chǎn)生新突破,同時帶動相關(guān)科學(xué)技術(shù)的共同發(fā)展[3]。
2.2體現(xiàn)出大科學(xué)的研究模式
最初人們在發(fā)展生物醫(yī)學(xué)這門學(xué)科的時候,研究模式一般具有小科學(xué)的特征,然而,人類基因組計劃卻拉開了大科學(xué)研究的序幕,具體有以下幾點特征:第一,所研究的項目具有較大社會規(guī)模,涉及到的領(lǐng)域、人員較多;第二,研究項目中包含的知識量較大,知識的積累速度也非常快;第三,整個研究項目能夠體現(xiàn)出一種加快發(fā)現(xiàn)的趨勢;最后,整個項目能夠產(chǎn)生明顯的社會效應(yīng)。可以說大科學(xué)的研究模式是小科學(xué)研究的必然結(jié)果,這兩種研究方式都有自身的規(guī)律和特點,因此研究過程中要趨利避害,為生物醫(yī)學(xué)這一領(lǐng)域的進一步發(fā)展打下堅實的基礎(chǔ)。
2.3臨床醫(yī)學(xué)中體現(xiàn)出“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)”特征
生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展的確為決絕臨床問題作出了重要貢獻,但是在分析近幾年生物醫(yī)學(xué)的研究內(nèi)容我們會發(fā)現(xiàn)其呈現(xiàn)出以下趨勢:隨著研究水平的提升,研究內(nèi)容越來越復(fù)雜,有相當(dāng)一部分研究已經(jīng)脫離了臨床實際,這對于解決臨床問題是十分不利的。任何一門學(xué)科的發(fā)展都是要為人類服務(wù),因此對于學(xué)科的研究要遵循以人為本的原則,在這種形勢下人們提出了轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的概念,就是通過多種途徑將人們在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域取得的成果迅速轉(zhuǎn)化為解決臨床問題的技術(shù)和方法,用一條快速通道來連接病房和實驗室,實現(xiàn)基礎(chǔ)研究與臨床的有效整合[4]。
3總結(jié)
在現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)的推動下,生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展已經(jīng)步入了新階段,對生命過程的研究已經(jīng)從宏觀過渡到了微觀,對于進一步觀察生命過程、有效預(yù)防和治療各類疾病具有重要意義,我們應(yīng)該認真分析生物醫(yī)學(xué)的特征和發(fā)展規(guī)律,明確各個學(xué)科之間的影響,建立完善的生物醫(yī)學(xué)研究系統(tǒng),促進這門學(xué)科的進一步發(fā)展。
參考文獻
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[2]張寧,羅長坤.當(dāng)前生物醫(yī)學(xué)發(fā)展的幾個主要特征及其對醫(yī)學(xué)科研管理的影響[J].中華醫(yī)學(xué)科研管理雜志,2005,13(15)01:14-16.
[3]施忠道.淺析新世紀(jì)我國生物醫(yī)學(xué)科技發(fā)展的趨勢與重點[J].醫(yī)學(xué)與社會,2000,11(13)05:4-7.
篇9
在塔里木河千變?nèi)f化的廣闊流域中,生長著胡楊、沙棗、鈴鐺刺、紅柳……也生活著各種各樣的人,展示著截然不同的人生面向,但這些人卻有著同樣的性格——吃苦耐勞、默默奉獻。
塔里木大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院院長、塔里木盆地生物資源保護利用重點實驗室主任張利莉教授就是其中一員,“努力、精干、大氣、氣質(zhì)過人、平易近人”,這些形容詞是她的學(xué)生、同事、領(lǐng)導(dǎo)給予她的評價,不盡相同,可是他們卻說這就是張利莉。
30年,可以讓一個人有多少人生面向,讓我們一起走進張利莉,一名學(xué)者、一名老師、一個女人的多彩人生。
學(xué)生·教師·學(xué)者·領(lǐng)航人
1979年,張利莉過得并不平坦。
這一年,張利莉只有16歲,剛剛經(jīng)歷人生中的一件大事——高考,并且收到了塔里木大學(xué)(原塔里木農(nóng)墾大學(xué))農(nóng)學(xué)專業(yè)的錄取通知書,但是從小學(xué)習(xí)成績優(yōu)異、心氣甚高的張利莉卻高興不起來。
“我一直認為自己可以考上更好的大學(xué),可是那年發(fā)揮極不正常,分?jǐn)?shù)不高,看著塔里木大學(xué)的通知書,我只想去復(fù)讀。”張利莉坦言。
這一年9月,倔強的張利莉沒有奔赴“象牙塔”,毅然決然地選擇了復(fù)讀。她回憶說:“枯燥的復(fù)讀生活并沒有讓我平靜下來,最痛苦的是老師講的知識我都懂,幫老師批改作業(yè)成了每天生活的主要內(nèi)容。”
這樣的生活過了一個月,張利莉終于坐不住了。
“當(dāng)時我想,這樣下去第二年未必有好結(jié)果,不如放下身段去上大學(xué),路在腳下,只要努力,也許在塔里木大學(xué)可以闖出一片新天地。”就這樣,張利莉坐上了開往阿拉爾的班車。
來到阿拉爾,張利莉并沒有被這里的惡劣氣候和艱苦條件嚇倒,因為她從小到大生活的三師四十四團,自然環(huán)境和阿拉爾相差不大,風(fēng)沙、干燥、炎熱,對于那個時候的她來說是家常便飯。
在張利莉的記憶中,她的大學(xué)生活大部分是在教室、自習(xí)室、圖書館和實驗室里度過的。
“那個年代,一批來自內(nèi)地的老師在塔里木大學(xué)授課,我們使用的是全國材。也就是說,我們和內(nèi)地一些著名農(nóng)業(yè)大學(xué)有著同等的教學(xué)條件。那些老師就是我們的啟蒙者。”深受老師影響的張利莉,四年大學(xué)成績總評達到90分以上,留校當(dāng)一名老師的想法也慢慢浮上腦海。
在計劃分配盛行的1983年,張利莉因為成績優(yōu)異留校,成了塔里木大學(xué)的一名教師。雖然心愿順利實現(xiàn),但是所教課程卻讓她有些愕然——微生物學(xué)。
沒有成為自己心儀的遺傳學(xué)、植物生理學(xué)的老師,讓年僅20歲的張利莉有些郁悶。多年以后,張利莉明白了當(dāng)年學(xué)校的這個決定,“學(xué)校唯一教微生物學(xué)的老教師馬上要退休,學(xué)校安排我接他的班。”
之后幾十年里,張利莉一心撲到微生物學(xué)的教學(xué)和科研中。上世紀(jì)八九十年代,她先后考上華中農(nóng)業(yè)大學(xué)微生物專業(yè)的碩士和博士,在微生物學(xué)最高殿堂的熏陶下,張利莉逐漸成為一名優(yōu)秀的微生物學(xué)學(xué)者。
如今,張利莉已經(jīng)是塔里木大學(xué)微生物重點學(xué)科帶頭人、兵團重點學(xué)科生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)科領(lǐng)航人、自治區(qū)微生物學(xué)精品課程負責(zé)人。她所負責(zé)的芽孢桿菌分子生物學(xué)和極端微生物及基因資源項目研究,均達到國內(nèi)先進水平。
朋友·同事·老師·帶頭人
2011年,彭麗桃作為援疆干部來到塔里木大學(xué)。
作為華中農(nóng)業(yè)大學(xué)的校友,談起張利莉,現(xiàn)任塔里木大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院副院長彭麗桃說出了兩個字——完美。
“阿拉爾是個遙遠的地方,尤其對于科研而言,對外交流和獲取信息很不方便,但是塔里木大學(xué)就像是沙漠中的‘圣地’,這里有最質(zhì)樸的學(xué)生和最敬業(yè)的老師,正是他們給了我在這里工作的動力。”彭麗桃回憶起兩年的援疆經(jīng)歷感慨道。
張利莉就是讓彭麗桃感動的老師之一。2011年,他來到塔里木大學(xué),學(xué)校的學(xué)科設(shè)置和科研平臺已經(jīng)基本建立,而建立的過程卻充滿艱辛。
2002年,作為國家公派訪問學(xué)者的張利莉,結(jié)束了在日本東京大學(xué)細胞分子生物學(xué)研究所的交流學(xué)習(xí),回到了塔里木大學(xué)。
回國后,張利莉意識到,不論是塔里木大學(xué)的發(fā)展,還是南疆的社會經(jīng)濟發(fā)展,建立一個科研平臺已經(jīng)迫在眉睫。為了讓自己的科研項目得到國家、兵團的支持,2003年她一次就申報了6項課題。然而,沒有一項通過審批。
那時,塔里木大學(xué)的實驗室分布在各個學(xué)院,師資力量不集中,研究不系統(tǒng)。2004年,在張利莉的推動下,塔里木大學(xué)集全校之力建立了塔里木盆地生物資源保護利用重點實驗室。
也是那一年,塔里木大學(xué)建立起第一個比較規(guī)范的、有著系統(tǒng)研究方向的實驗室,這個實驗室的建立也成為塔里木大學(xué)科研事業(yè)的一座里程碑。
如今,這個實驗室已經(jīng)成為生命科學(xué)學(xué)院的科研支柱。張利莉的學(xué)生羅曉霞博士畢業(yè)后,正是因為這個實驗室,回到了她的身邊。
羅曉霞說,能回到塔里木大學(xué)工作,很大一部分原因是因為張利莉。
“本科階段,張老師就教我農(nóng)業(yè)微生物課程,為了讓我們有好的發(fā)展,從大二開始,她就開始督促我們學(xué)習(xí),鼓勵我們考研究生。”羅曉霞說,“但是,在研究生階段,我選擇的育種課題進展極其緩慢,張老師非常著急,為了能讓我順利畢業(yè),她專門為我挑選更換了研究方向,她是一個非常為學(xué)生著想的人。”
博士畢業(yè)后,張利莉告訴了羅曉霞如今生命科學(xué)學(xué)院的情況,當(dāng)聽說張利莉的團隊正缺少人手時,羅曉霞毅然選擇回到塔里木大學(xué)。
“我研究的是微生物精工程方向,在這一學(xué)科里,張老師已經(jīng)做了大量的前期工作,我相信加入她的團隊,一定會有所作為。”羅曉霞說。
女兒·妻子·母親·普通人
4月23日,記者走進張利莉的辦公室,辦公桌上整齊擺放著各類書籍和文件,柜子上擺放著她和同事、學(xué)生的合影,窗邊的植物茁壯的生長著……這一切都讓人深切感受到,房間的主人是如此熱愛工作和生活。
無意間,記者在她座椅邊的檔案柜門上,發(fā)現(xiàn)了兩張很小的照片——張利莉和一個小女孩的合影。
塔里木盆地生物資源保護利用重點實驗室副主任萬傳星告訴記者:“那是張老師和她女兒的合影,為了學(xué)習(xí)和工作,她犧牲了很多陪伴女兒的時間。”
4月27日,在采訪中,記者和張利莉聊起了她的女兒,她沉默半晌,眼淚奪眶而出,輕輕的話語中,記者只聽見了“愧疚”二字。
“不管你是什么樣的人,都要勤勤懇懇做事。”這句話幾乎成了張利莉的人生信條。
在塔里木大學(xué),張利莉的職務(wù)很多,科技處處長、實驗室主任、生命科學(xué)學(xué)院院長,不一而足,但是幾乎所有人都稱呼她為“老師”。
4月底,張利莉獲得了“全國五一勞動獎?wù)隆保@是對她常年扎根邊疆、勤勉工作的充分肯定,也是繼“全國模范教師”、“全國三八紅旗手”、“全國優(yōu)秀科技工作者”榮譽稱號之后獲得的又一個國家級殊榮。
篇10
關(guān)鍵詞: DNA提取 土壤 微生物多樣性
土壤是微生物生活的主要場所,蘊含著豐富的微生物資源并表現(xiàn)出高度的多樣性,據(jù)估計每克土壤中含有4000-7000種近109個細菌細胞,含有幾千到上百萬種不同的基因組信息。長期以來,對土壤微生物的研究僅限于極少部分可培養(yǎng)的微生物,而這種可培養(yǎng)的微生物還不到自然界微生物總量的1%,實際上絕大多數(shù)環(huán)境微生物都是不可或很難被培養(yǎng)的,利用傳統(tǒng)的培養(yǎng)方法研究土壤微生物多樣性,具有很強的偏好性。隨著發(fā)展起來的宏基因組學(xué)利用分子生物學(xué)的研究方法繞過培養(yǎng)方法來研究微生物多樣性及功能這一局限,為土壤微生物研究開辟了新的道路[1]。而宏基因組學(xué)技術(shù)在研究土壤微生物方面的關(guān)鍵第一步是提取DNA。
提取高濃度、大片段、多樣性程度高、具有代表性的土壤微生物總DNA對土壤微生物多樣性研究至關(guān)重要。然而,土壤是一個非常復(fù)雜的異質(zhì)體系,其中含有的腐植酸及腐植酸類似物、酚類化合物、重金屬離子等,在DNA提取過程中如不能有效去除,將直接影響后續(xù)的PCR擴增、核酸雜交、內(nèi)切酶消化等分子操作[2]。土壤微生物DNA的提取純化是一個耗時、繁瑣的過程,許多學(xué)者一直在探索更加快速、高效、低成本的土壤DNA提取方法。下面就近年來已發(fā)表的國內(nèi)外DNA提取相關(guān)方面的文獻,對DNA提取作了些論述。
一、土壤DNA
土壤中的DNA主要存在于細胞核內(nèi),核內(nèi)DNA占整個細胞DNA量的90%以上,核外DNA主要有線粒體DNA和質(zhì)粒DNA,因此,土壤DNA提取主要獲得的是核內(nèi)DNA[3]。
二、影響土壤DNA提取的主要因素
影響土壤DNA提取的因素主要有以下幾點:1)DNA與土壤環(huán)境基質(zhì)的相互作用。DNA與粘土礦物、高含量有機質(zhì)等之間的吸附會降低DNA提取產(chǎn)量。2)DNA共提取物。土壤中含有的腐植酸及腐植酸類似物、酚類化合物、重金屬離子等對土壤DNA提取存在影響,限制性內(nèi)切酶活性在共提取的腐植酸濃度為0.8-51.71μg/mL時就受到抑制,且Taq聚合酶對腐植酸具有高抑制敏感性[4]。3)DNA的降解、損失或損傷。土壤樣品保存方法不當(dāng),會導(dǎo)致微生物細胞降解或DNA降解,如土壤樣品儲存在4℃下3周,高分子量DNA顯著減少[5];還有DNA提取過程越繁瑣或步驟越多,DNA損失就越多,DNA提取過程中的剪切力也會對DNA分子會造成損傷。4)細胞不完全裂解。
三、土壤DNA提取方法
土壤樣品的DNA提取,通常包括細胞裂解、細胞碎片的去除和核酸的沉淀與純化三個步驟。根據(jù)微生物細胞是否需要從他們的環(huán)境基質(zhì)中分離出來,可將DNA提取方法分為直接法和間接法,直接法耗時短且具有更好的DNA恢復(fù)率,可以獲得更好體現(xiàn)樣品微生物多樣性的代表性DNA,從而直接法得到更為普遍的應(yīng)用[6]。
已經(jīng)出現(xiàn)了很多被接納并廣泛使用的土壤DNA提取方法,可以說這些方法被當(dāng)作了標(biāo)準(zhǔn)。其中,Zhou 等[7]于1996年提出了一種多元組成土壤DNA恢復(fù)方法,該研究為應(yīng)對某一具體的土樣提供了指導(dǎo)便于選擇適當(dāng)?shù)腄NA提取和純化方法。有人在此基礎(chǔ)上,改進了方案,來提取幾種性質(zhì)不同的土壤樣品DNA,并得到了較好的結(jié)果[8]。而有些土壤樣品來自于極端環(huán)境或由于本身特性,提取出滿足用于分子分析的DNA比較困難。這時結(jié)合使用不同的細胞裂解方法就顯得特別重要(常見的細胞裂解方法見表1)。例如引進土壤預(yù)洗滌程序用于提取一般有機質(zhì)(腐植酸)和金屬離子含量比較高的森林土樣DNA,DNA提取產(chǎn)量和質(zhì)量可以得到改善[9]。風(fēng)沙土壤本身微生物數(shù)量較低,需要采取特殊的土壤處理方法,以獲得足夠產(chǎn)量的DNA,張穎等人也報道了一種風(fēng)沙土壤微生物總DNA提取方法,獲得的DNA可直接用于PCR分析[10]。還有,一些極端環(huán)境如火山土壤樣品DNA提取面臨著粘土和其他礦物含量高的難題,Ruth M.Henneberger等[11]嘗試了各種提取方法,最終成功地提取到了效果較好的DNA,這都證明了結(jié)合使用不同提取處理的重要性。
DNA提取技術(shù)除了在土壤樣品上的應(yīng)用外,還有很多其他的環(huán)境樣品如沉積物、堆肥、植物組織、動物標(biāo)本、消化物或糞便、骨骼牙齒、化石冰與凍土、碳酸鹽巖石、唾液等。另一方面,DNA提取技術(shù)的不斷發(fā)展與成熟也促進了市場上出現(xiàn)了許多各種各樣的商業(yè)化DNA提取試劑盒。S.M. Dineen等[12]比較了6種商業(yè)DNA提取試劑盒用于三種土樣細菌孢子的DNA提取,結(jié)果表明FastDNA?SPIN kit提取DNA產(chǎn)率最高,而E.Z.N.A.?Soil DNA和PowerSoil?DNA Isolation kits在去除壤土提取物中PCR抑制物方面表現(xiàn)出最高的效率。
以上所訴的大多屬于直接法,直接法雖然產(chǎn)量高,但是純度一般較低,有時需要進一步的純化,獲得的DN段也較小;相對而言,間接法雖然需要另外的特殊處理材料和足夠的土壤數(shù)量,耗時長,但獲得的DNA純度高、長片段多,且含有更少的真核基因序列,在進行深入的微生物群落測序和克隆構(gòu)建福斯質(zhì)粒文庫方面,間接法是一個有用的方法[13]。
四、土壤DNA提取方法對土壤微生物多樣性分析的偏差影響
已報道的從土壤中提取DNA的方法有很多種,但大多數(shù)只適用于有限的土壤類型,這些核酸提取方法也會有復(fù)雜的低效性,不可避免地會引進各自的偏差[14]。Jan Dirk van Elsas等[15]比較分析了四種提取方法獲得的DNA多樣性,發(fā)現(xiàn)方法對表觀豐度和群落結(jié)構(gòu)有明顯的影響,其中,通過兩種方法獲取土壤DNA得到了一種迄今未描述的放線菌組。為了改善宏基因組方法,研究DNA提取偏差以及提供一些工具便于評價不同組的豐度,Tom O.Delmont等[16]人也設(shè)計并開展了實驗,他們的工作強調(diào)了提取的DNA庫與目前無法獲取的完整土壤宏基因組之間的不同。
目前,絕大多數(shù)土壤微生物基因組總DNA提取時采用的是一次裂解,而一次裂解并不能得到較為完全的土壤宏基因組,因此一般基于提取的DNA分析獲得的土壤微生物多樣性可稱為表觀土壤微生物多樣性。為了盡量獲取完整的土壤樣品DNA,Larry M.Feinstein等[17]在評估了一個常用土壤DNA提取試劑盒時,改變了細胞裂解方案,對粘土、砂土和有機質(zhì)土壤子樣品進行多次連續(xù)DNA提取,得出大部分DNA能夠通過前幾次提取獲得,并且通過集中三次連續(xù)提取,DNA提取的偏差可以得到很大程度降低。同樣,郭等的實驗結(jié)果也證實了這點,土壤DNA的3次連續(xù)提取最低回收率占5次連續(xù)提取的76%以上,而且與新鮮土壤相比,風(fēng)干過程顯著降低了土壤微生物豐度,但利用風(fēng)干土壤中微生物豐度的變化趨勢反映新鮮土壤中微生物數(shù)量變化規(guī)律具有一定的可行性,這也為使用風(fēng)干土壤進行土壤微生物多樣性研究提供了一定的依據(jù)[18]。
五、討論與展望
對于同一份土壤樣品,不同的DNA提取方法獲得的DNA往往具有差異而表現(xiàn)出方法特異性。DNA提取也會有復(fù)雜的低效性,土壤宏基因組DNA的不完全提取,土壤中的腐植酸、蛋白質(zhì)等物質(zhì)對PCR的抑制,這些都會對土壤微生物多樣性造成偏低的評估,提取的土壤DNA質(zhì)量將直接影響到后續(xù)的分子生物學(xué)分析的真實性。目前,沒有一種DNA提取方法適用于所有類型的土壤樣品,在面對一些棘手的土壤樣品DNA提取時,可采取一些不同的提取方法。
土壤DNA提取是進行土壤分子生物學(xué)分析的關(guān)鍵步驟,也是一個限制步驟。隨著PCR芯片和高通量測序技術(shù)的不斷發(fā)展和應(yīng)用,對大批量土壤樣品DNA的快速獲取也變得迫切需求。雖然市場上出現(xiàn)的商業(yè)DNA提取試劑盒已為土壤DNA的獲取提供了不少方便,但在應(yīng)對較多的土壤樣品量,還是需要消耗較多時間來手工操作,缺乏自動高效性。 因此,必須尋求更加高效的DNA提取方法。■
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