導(dǎo)語(yǔ)：如何才能寫好一篇生物信息學(xué)概念，這就需要搜集整理更多的資料和文獻(xiàn)，歡迎閱讀由公務(wù)員之家整理的十篇范文，供你借鑒。

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一、圍繞生物核心概念精心設(shè)計(jì)教學(xué)，落實(shí)三維目標(biāo)

在初中生物教學(xué)設(shè)計(jì)中，教師可以根據(jù)學(xué)生已經(jīng)掌握的概念和沒(méi)有學(xué)習(xí)的概念、先前掌握的概念和后來(lái)掌握的概念、具體的概念和抽象的概念之間的關(guān)系，設(shè)計(jì)多種小組合作教學(xué)活動(dòng)，在教學(xué)過(guò)程中發(fā)現(xiàn)問(wèn)題、資源整合、依據(jù)科學(xué)事實(shí)，幫助學(xué)生在處理加工轉(zhuǎn)化信息過(guò)程中，構(gòu)建初中生物核心概念的意義。新課程倡導(dǎo)“以學(xué)生發(fā)展為本”的新課改理念，三維教學(xué)目標(biāo)是相互滲透并融合的，它們緊緊地貫穿于每一位學(xué)生的成長(zhǎng)與能力發(fā)展過(guò)程之中。初中生物科學(xué)素養(yǎng)的核心是生物技能，掌握生物技能的前提是領(lǐng)會(huì)生物核心概念。如果把生物科學(xué)素養(yǎng)比做一座“金字塔”，由三維目標(biāo)構(gòu)成，那么，生物核心概念就是這座“金字塔”的框架圖，知識(shí)與能力就是這座“金字塔”的根基；過(guò)程與方法、情感態(tài)度價(jià)值觀就是“金字塔”的上層建筑。框架圖設(shè)計(jì)的精確，根基才會(huì)穩(wěn)固，那么生物教學(xué)的根基才會(huì)更加穩(wěn)固，“上層建筑”才能發(fā)展得越高。高效的生物教學(xué)，就是經(jīng)過(guò)理解生物核心概念，使學(xué)生在知識(shí)和能力，情感態(tài)度價(jià)值觀獲得進(jìn)步與發(fā)展，并提高學(xué)生的生物科學(xué)素養(yǎng)。

二、用思維導(dǎo)圖來(lái)組織教學(xué)

以基因?yàn)槔龑?dǎo)學(xué)生總結(jié)“性狀”，分析每個(gè)人各種性狀的遺傳，總結(jié)出人的性狀與父母的關(guān)系，為學(xué)生學(xué)習(xí)基因?qū)π誀畹臎Q定奠定基礎(chǔ)，再以基因?yàn)楹诵模龌虻念愋停猴@性基因和隱性基因。教師可以將基因?qū)π誀畹目刂七M(jìn)行適當(dāng)分析與講解，然后以某一種性狀來(lái)分析基因的決定作用，如有無(wú)耳垂的圖解，可以先用最簡(jiǎn)單的圖解，然后層層遞進(jìn)；嘗試讓學(xué)生分析最復(fù)雜的基因決定方式，如血型的基因決定方式，學(xué)生在學(xué)習(xí)過(guò)程中便會(huì)真正體會(huì)到基因?qū)θ说男誀畹臎Q定。

三、提倡科學(xué)探究教學(xué)講授生物核心概念

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關(guān)鍵詞：高中生物；核心概念；教學(xué)策略

1.以生命科學(xué)史教學(xué)為主的高中生物課堂教學(xué)

新課改以來(lái)，生物教材的編寫更加注重生物科學(xué)素養(yǎng)的培養(yǎng)和科學(xué)方法的訓(xùn)練，使得學(xué)生更加理解知識(shí)以至形成較為正確的科學(xué)觀念和正規(guī)生物學(xué)科學(xué)習(xí)理念，讓學(xué)生對(duì)生物科學(xué)史能夠加深其自身過(guò)程理解能力和本質(zhì)理解能力等，此類方式無(wú)疑是當(dāng)前我國(guó)高中生物教學(xué)過(guò)程中教學(xué)效果最為明顯的一種教學(xué)形式。需要注意的是，就具體高中生物教學(xué)而言，生物課程概念理解尤為重要，其主要體現(xiàn)在核心概念形成上、核心概念發(fā)展過(guò)程上和核心概念內(nèi)部自含方法上，所以利用生物科學(xué)史速進(jìn)學(xué)生對(duì)生物核心概念建構(gòu)的確切實(shí)可行。

2.通過(guò)比喻來(lái)使一些抽象化的問(wèn)題變得簡(jiǎn)單易懂

在生物學(xué)核心概念中，抽象化生物概念居多，學(xué)生并不是很好理解，那么我們就需要將這些抽象化概念來(lái)進(jìn)行具體化形式體現(xiàn)，再把具體事物抽象出來(lái)，同時(shí)將其運(yùn)用適當(dāng)方法加以表現(xiàn)，可使學(xué)生直觀了解相關(guān)高中生物抽象化基本概念和基本含義。最為常見(jiàn)的例子即為生物核心概念“染色體組”，在此案例中，可用撲克牌的類比方法來(lái)教予學(xué)生；“減數(shù)分裂”可以通過(guò)橡皮泥反應(yīng)染色體形態(tài)變化模型方法來(lái)進(jìn)行傳授，把父母雙方染色體分別用不同顏色的橡皮泥來(lái)予以正確表示，只有這樣才能夠在一定程度上以生動(dòng)形象的方式表現(xiàn)出減數(shù)分裂各個(gè)時(shí)期染色體所表現(xiàn)的行為。這種比喻方法可以使學(xué)生對(duì)生物學(xué)概念的抽象從而變得簡(jiǎn)單通俗，更能夠加強(qiáng)學(xué)生對(duì)此種教學(xué)方法的理解能力。

3.運(yùn)用比較來(lái)尋找差異

生物核心概念中大都意義相近或關(guān)系較為密切，這便會(huì)使學(xué)生對(duì)一些生物概念比較容易混淆，以至不便于學(xué)生理解和學(xué)生掌握。例如就拿光合作用于呼吸作用來(lái)比較，可以通過(guò)它們的反應(yīng)場(chǎng)所、條件以及物質(zhì)變化和能量變化等四個(gè)方面來(lái)做對(duì)比，從中可以看出，光合作用是通過(guò)植物、藻類和某些細(xì)菌以二氧化碳和水做原料，必須有葉綠體的情況下通過(guò)光合作用形成含糖的有機(jī)物，之后在此基礎(chǔ)上進(jìn)行有機(jī)物的合理存儲(chǔ)，但此時(shí)呼吸作用則與之相反。這樣通過(guò)對(duì)比來(lái)了解兩者之間的聯(lián)系和差異，以便加深學(xué)生對(duì)這兩個(gè)概念的理解和認(rèn)知。

4.對(duì)高中生物核心概念的剖析

從生物學(xué)資料和生物學(xué)科網(wǎng)絡(luò)資源中可以看出，現(xiàn)下國(guó)內(nèi)較為常見(jiàn)的一種高中生物核心概念就是一種名字解釋和學(xué)科基本定義。我們通常所說(shuō)的高中生物核心概念就是高中生物重點(diǎn)概念和學(xué)科自身內(nèi)部重點(diǎn)名詞以及解釋等。所以，高中生物學(xué)科蛋白質(zhì)、高中生物學(xué)科核酸、高中生物學(xué)科光合作用、高中生物學(xué)科呼吸作用、高中生物學(xué)科中心法則、高中生物學(xué)科生態(tài)系統(tǒng)等等皆被視為高中生物學(xué)科核心概念，教師認(rèn)同感倍增。此條首要一點(diǎn)就是要抓住生物核心概念關(guān)鍵詞，例如同源染色體的概念是：配對(duì)兩條染色體，染色體形狀和染色體大小一般情況下大都處于等同狀態(tài)，一條來(lái)自父方，一條來(lái)自母方，此種形式亦被稱為叫做同源染色體。

5.使用多媒體輔助工具等進(jìn)行加深理解和認(rèn)知

隨著現(xiàn)代社會(huì)科技的飛速發(fā)展，多媒體文化教育技術(shù)已經(jīng)越來(lái)越成熟普遍。通過(guò)計(jì)算機(jī)對(duì)視圖、文字、動(dòng)畫、音頻的處理可以使一些抽象的生物概念被形象生動(dòng)的表現(xiàn)出來(lái)，此項(xiàng)技術(shù)具有圖、文、聲并茂，刺激多種感官認(rèn)知以至學(xué)生加強(qiáng)對(duì)生物概念理解和對(duì)此類生物學(xué)概念意義長(zhǎng)久保持，同時(shí)也能夠渲染優(yōu)異教學(xué)環(huán)境，營(yíng)造良好學(xué)習(xí)氣氛。之后在此基礎(chǔ)上做出概念圖來(lái)對(duì)基本概念進(jìn)行系統(tǒng)分析，一般構(gòu)建一個(gè)完整的概念圖需要以下幾個(gè)步驟：擬定一個(gè)生物概念主題，列出與主題相關(guān)的概念；將被整理出的主要概念進(jìn)行科學(xué)合理排序，按照概念的邏輯關(guān)系和等級(jí)確定關(guān)系；初步擬定概念圖的縱向分層和橫向分支；用連線方式建立概念之間關(guān)系連接并注明兩者之間關(guān)系；通過(guò)射線來(lái)標(biāo)明兩者間主從關(guān)系；為了更加全面了解概念圖的解析，下面復(fù)雜概念圖便能夠?qū)Υ祟愔R(shí)進(jìn)行全面闡述和說(shuō)明，表明了高中生物概念教學(xué)細(xì)胞增殖方式、高中生物概念教學(xué)意義等生物核心概念的基礎(chǔ)性關(guān)聯(lián)，適時(shí)突出各種核心概念間的有效關(guān)系。

上圖我們可以清楚劃分各概念之間主從關(guān)系，高中生物核心概念教學(xué)中，學(xué)生更能夠?qū)Σ糠指咧猩飳W(xué)科概念和內(nèi)容加深理解，無(wú)論是在教師授課上，還是以后學(xué)生的系統(tǒng)復(fù)習(xí)中，教學(xué)效果尤為明顯，可將零散知識(shí)逐步系統(tǒng)化，系統(tǒng)知識(shí)逐步零散化，使學(xué)生在生物概念的整個(gè)學(xué)習(xí)過(guò)程更加積極、主動(dòng)。

結(jié)束語(yǔ)

綜上所述，高中生物課堂教學(xué)過(guò)程中應(yīng)以學(xué)生為整個(gè)結(jié)構(gòu)教學(xué)體系中的主體，發(fā)揮出教室原有教學(xué)引導(dǎo)作用，加大概念教學(xué)力度，大力培養(yǎng)學(xué)生自主實(shí)踐能力和綜合素質(zhì)，對(duì)課堂任務(wù)和課堂教學(xué)內(nèi)容進(jìn)行仔細(xì)分配，然后根據(jù)學(xué)生具體學(xué)習(xí)情況，合理安排課后作業(yè)和實(shí)踐活動(dòng)。本文針對(duì)當(dāng)前我國(guó)高中生物教學(xué)現(xiàn)狀，對(duì)高中生物課堂有效教學(xué)的相應(yīng)教學(xué)策略和教學(xué)途徑進(jìn)行詳細(xì)分析和闡述，希望為我國(guó)高中教育事業(yè)的發(fā)展提出相應(yīng)合理化建議。

參考文獻(xiàn)：

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[2]張洪榮。《淺談生物學(xué)基本概念教學(xué)中的設(shè)疑方法》中學(xué)生物學(xué)2002（02）：：1-14

[3]李良《高中生物基本概念的教學(xué)》學(xué)科教研教苑2003（6）：11-12

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關(guān)鍵詞：生物信息學(xué)；實(shí)踐教學(xué)；教學(xué)模式

中圖分類號(hào) G642.0 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 1007-7731（2017）06-0179-03

Innovative Teaching Pattern of Bioinformatics

Zhu Liucun et al.

（School of Life Sciences，Shanghai University，Shanghai 200444，China）

Abstract：As a newly-developing interdiscipline，bioinformatics has received incessant attention on the research of teaching models.Traditional teaching methods focus on the pattern of direct instruction and demonstration from the lecturer which students were used to learning in China.However，this straight teaching pattern usually lacks of capacity of arousing students' interest in learning，let alone achieves the aim of making them complete their work with the knowledge they learned in class.Recently，case-based learning，problem-based learning and program-based learning are known as successfully innovative teaching models.In this paper，by combining these three models and considering the background of students and characteristic of bioinformatics，we propose a new teaching pattern to be geared to the needs of the undergraduates learning bioinformatics.We look forward to the innovation and development this teaching pattern may achieve so as to enhance the students' capacity of independent study and thinking.

Key words：Bioinformatics；Practice teaching；Teaching pattern

1 前言

生物信息學(xué)是生命科學(xué)的重要前沿交叉學(xué)科之一，綜合計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)、生物學(xué)等學(xué)科的技術(shù)和方法，以計(jì)算機(jī)為主要的工具，對(duì)生物原始數(shù)據(jù)進(jìn)行研究、存檔、分析和處理，以闡明其具有的生物學(xué)意義[1，2]。隨著人類基因組計(jì)劃的成功完成，測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，越來(lái)越多的生物基因序列數(shù)據(jù)被載入到數(shù)據(jù)庫(kù)中。而大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來(lái)要求我們能大規(guī)模的分析處理這些數(shù)據(jù)，因此生物信息學(xué)進(jìn)入高速發(fā)展的黃金期。

目前生物信息學(xué)在許多高校本科生物專業(yè)中開設(shè)，目的是讓學(xué)生掌握生物信息學(xué)的相關(guān)技術(shù)及分析數(shù)據(jù)能力，并具有查找、跟蹤生物信息學(xué)前沿性技術(shù)的能力。然而，在與學(xué)生的交流過(guò)程中，筆者發(fā)現(xiàn)幾個(gè)普遍存在的問(wèn)題：有的學(xué)生反映，聽完課很快就忘了；有的學(xué)生感覺(jué)很多概念太難懂；而更為關(guān)鍵的是，很多學(xué)生學(xué)完這門課之后，仍然不知道遇到具體的問(wèn)題應(yīng)當(dāng)如何去做，甚至根本想不到用生物信息學(xué)課上學(xué)到的方法去解決他們的實(shí)際問(wèn)題。究其原因，主要是由于國(guó)內(nèi)的生物信息學(xué)教學(xué)基本以教師講授為主，缺少與學(xué)科本身交叉前沿性特點(diǎn)相結(jié)合的教學(xué)方法[3]，導(dǎo)致學(xué)生學(xué)習(xí)積極性不高，變成簡(jiǎn)單的重復(fù)老師的實(shí)驗(yàn)操作，失去獨(dú)立思考的能力，這就違背了開設(shè)這門課的初衷。為此，本文就目前流行的3種創(chuàng)新教學(xué)模式的特點(diǎn)進(jìn)行分析，結(jié)合生物信息學(xué)特點(diǎn)，歸納出一套適合本科生物信息學(xué)教學(xué)的方法。

2 幾種創(chuàng)新教學(xué)模式介紹

2.1 案例式教學(xué)法 案例式教學(xué)法（Case-Based Learning）是指教師根據(jù)教學(xué)內(nèi)容設(shè)計(jì)案例，利用案例材料指導(dǎo)學(xué)生參與教學(xué)活動(dòng)，充分發(fā)揮學(xué)生主導(dǎo)地位的方法[3，4]。不同于傳統(tǒng)教學(xué)灌輸?shù)姆绞剑咐浇虒W(xué)更加注重學(xué)生能力的培養(yǎng)，不直接提供解決問(wèn)題的標(biāo)準(zhǔn)答案，而是通過(guò)結(jié)合具體案例討論得到解決問(wèn)題的方法。

2.2 問(wèn)題式教學(xué)法 問(wèn)題式教學(xué)法（Problem-Based Learning）是以問(wèn)題為導(dǎo)向的開放式教學(xué)模式[5]，主張讓學(xué)生自主學(xué)習(xí)去解決問(wèn)題，培養(yǎng)學(xué)生的學(xué)習(xí)主動(dòng)性，加深學(xué)生對(duì)理論知識(shí)的理解和應(yīng)用。其特點(diǎn)是將教材的知識(shí)點(diǎn)以問(wèn)題的形式呈現(xiàn)在學(xué)生的面前，讓學(xué)生在探索解決問(wèn)題的過(guò)程中展開探索，教師和學(xué)生一起協(xié)作尋找解決問(wèn)題的方法，從而掌握課本中的知識(shí)。在研究活動(dòng)中，學(xué)生可以充分利用身邊的資源，比如圖書館的文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)、網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)軟件以及多媒w等多種形式進(jìn)行自主學(xué)習(xí)。問(wèn)題式教學(xué)模式營(yíng)造了一種輕松快樂(lè)的學(xué)習(xí)氛圍，提高了學(xué)生相互合作的團(tuán)隊(duì)意識(shí)，為以后步入社會(huì)工作打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。比如，在BLAST軟件使用教學(xué)中，可以先給學(xué)生提出如何對(duì)兩條DNA序列進(jìn)行比對(duì)的問(wèn)題，讓他們通過(guò)自學(xué)與相互討論的方式掌握BLAST的使用方法并將2條DNA序列利用BLAST進(jìn)行比對(duì)并對(duì)比對(duì)結(jié)果加以闡述。

2.3 項(xiàng)目式教學(xué)法 項(xiàng)目式教學(xué)法（Program-Based Learning）是以項(xiàng)目為主線，在老師的指導(dǎo)下，將一個(gè)相對(duì)獨(dú)立的項(xiàng)目交由學(xué)生處理，包括對(duì)信息的收集、方案的設(shè)計(jì)、項(xiàng)目的實(shí)施及最終評(píng)價(jià)[6]。學(xué)生通過(guò)對(duì)該項(xiàng)目的進(jìn)行，了解并把握整個(gè)程及每一個(gè)環(huán)節(jié)中的基本要求，以此來(lái)培養(yǎng)學(xué)生獨(dú)立分析解決問(wèn)題的能力，讓學(xué)生提高自己的動(dòng)手能力、組織協(xié)作能力和綜合概括的能力，拓展學(xué)生思考問(wèn)題的深度和廣度。這種教學(xué)法應(yīng)用非常廣泛，尤其是在職業(yè)教育中。

3 應(yīng)用于生物信息W課程的創(chuàng)新教學(xué)模式

那么采取哪種教學(xué)方式才能夠讓學(xué)生順利掌握知識(shí)點(diǎn)，并且能應(yīng)用到實(shí)際當(dāng)中去呢？一般的生物學(xué)課程，只要在理論課后加入實(shí)踐課的內(nèi)容，就可以解決這個(gè)問(wèn)題，例如細(xì)胞生物學(xué)，只要再加入細(xì)胞生物學(xué)實(shí)驗(yàn)，那么學(xué)生對(duì)這門課的理解就會(huì)加深很多，對(duì)這門課的應(yīng)用也會(huì)有一定的了解。然而筆者在實(shí)際的教學(xué)過(guò)程中卻發(fā)現(xiàn)，這樣的方式并不適合生物信息學(xué)這門課程，這是由于多數(shù)學(xué)生在上機(jī)實(shí)踐之后，仍然不是太理解課上講的一些概念，也不知道如何將這些方法運(yùn)用到實(shí)際中。造成這種情況的原因主要有兩點(diǎn)，一個(gè)是生物信息學(xué)這門課程所要求的數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)方面基礎(chǔ)，絕大多數(shù)學(xué)生物的學(xué)生都比較薄弱，甚至有部分同學(xué)在計(jì)算機(jī)編程方面是零基礎(chǔ)。這使得他們?cè)诶碚撜n上，對(duì)一些概念只是強(qiáng)行記住，并沒(méi)有真正理解。而在上機(jī)實(shí)踐環(huán)節(jié)中，他們又只是走馬觀花地將整個(gè)流程給過(guò)了一遍，并不知道這些操作是用來(lái)做什么的。另一個(gè)原因則是生物信息學(xué)與其他生物學(xué)的課程之間有脫節(jié)，這使得生物信息學(xué)的知識(shí)點(diǎn)很難融入到學(xué)生的現(xiàn)有知識(shí)體系當(dāng)中去，這樣就導(dǎo)致了學(xué)生不知道這些知識(shí)點(diǎn)的用途。因此，必須在激發(fā)學(xué)生學(xué)習(xí)興趣的基礎(chǔ)上，深入剖析生物信息學(xué)的基本概念，并且結(jié)合生物學(xué)中的實(shí)際問(wèn)題，引導(dǎo)學(xué)生對(duì)其進(jìn)行解決，才能讓學(xué)生真正掌握這門課。而傳統(tǒng)的老師講、學(xué)生聽的授課方式顯然是不能滿足這一要求的。

案例式教學(xué)法起源于美國(guó)哈佛商學(xué)院，最早應(yīng)用于商業(yè)管理課程。其重點(diǎn)在于對(duì)一些熱門且有爭(zhēng)議的問(wèn)題進(jìn)行反復(fù)討論，加深學(xué)生對(duì)知識(shí)點(diǎn)的理解。而生物信息學(xué)課程的內(nèi)容大多比較確定，比較前沿有爭(zhēng)議的話題又離日常生活較遠(yuǎn)，極少出現(xiàn)熱門話題。因此，筆者認(rèn)為案例式教學(xué)法目前可以偶爾用作課堂教學(xué)穿插，不適合全面應(yīng)用于本科生物信息學(xué)課程。

問(wèn)題式教學(xué)模式與項(xiàng)目式教學(xué)模式在本質(zhì)上是相同的，均是以學(xué)生為主體，讓學(xué)生帶著問(wèn)題或者有明確的目標(biāo)的去主動(dòng)利用身邊資源查找相關(guān)知識(shí)解決問(wèn)題完成目標(biāo)，使學(xué)生在探索過(guò)程不僅掌握了知識(shí)，同時(shí)萌生自主學(xué)習(xí)的動(dòng)機(jī)和欲望，提高了自主學(xué)習(xí)能力。兩種教學(xué)模式的區(qū)別在于問(wèn)題式教學(xué)法是將書本中的知識(shí)點(diǎn)凝練為問(wèn)題再分析問(wèn)題并解決問(wèn)題，而項(xiàng)目式教學(xué)法則是根據(jù)老師提出的項(xiàng)目要求，以收集信息、設(shè)計(jì)方案、實(shí)施項(xiàng)目、最終評(píng)價(jià)為線索進(jìn)行教學(xué)。問(wèn)題式教學(xué)提出的問(wèn)題與書本知識(shí)更為接近且較為零散，學(xué)生在針對(duì)問(wèn)題進(jìn)行分析和解決的過(guò)程中，容易對(duì)教學(xué)內(nèi)容缺乏整體認(rèn)識(shí)，即難以將知識(shí)點(diǎn)連成線，也很難結(jié)合實(shí)際問(wèn)題。而項(xiàng)目式教學(xué)法是目前最適合提高學(xué)生能力的教學(xué)方法。然而在實(shí)際教學(xué)過(guò)程中，筆者發(fā)現(xiàn)大多數(shù)學(xué)生對(duì)項(xiàng)目式教學(xué)并不適應(yīng)，很多學(xué)生在理解項(xiàng)目時(shí)就遇到了困難，在項(xiàng)目設(shè)計(jì)時(shí)感到無(wú)從下手。

因此，筆者在對(duì)兩種教學(xué)方法進(jìn)行研究歸納之后，將問(wèn)題式教學(xué)法與項(xiàng)目式教學(xué)法相結(jié)合，總結(jié)出一套適合本科生物信息學(xué)教學(xué)的方法。具體為：首先教師根據(jù)課程安排制定一個(gè)可擴(kuò)展的課題，明確課題要求，并根據(jù)課題內(nèi)容將知識(shí)點(diǎn)拆分，以問(wèn)題形式展現(xiàn)給學(xué)生，教師先就這些問(wèn)題講一些例子，學(xué)生查找資料。在此基礎(chǔ)上，學(xué)生既對(duì)課題內(nèi)容有整體認(rèn)識(shí)，又在分析、解決一系列小問(wèn)題時(shí)學(xué)習(xí)到知識(shí)點(diǎn)、收集了項(xiàng)目信息。隨后通過(guò)參與定期分組討論，與老師進(jìn)行溝通的方式，學(xué)生最終可以擬定項(xiàng)目的方案并付諸實(shí)施。這種教學(xué)模式讓學(xué)生了解實(shí)際工作的流程，培養(yǎng)基本的工作能力。在與教師的交流討論中收獲更多的專業(yè)知識(shí)，與同學(xué)之間的合作交流中查漏補(bǔ)缺，完善自己的不足，達(dá)到相互提高的作用。例如，在教學(xué)中，教師可以設(shè)計(jì)一個(gè)題為“構(gòu)建一個(gè)可以預(yù)測(cè)乳腺癌患者生存時(shí)間的基因模型”的項(xiàng)目，并將項(xiàng)目拆解為：如何查找潛在包含乳腺癌患者信息的數(shù)據(jù)庫(kù)？如何篩選與生存時(shí)間相關(guān)的基因？如何構(gòu)建模型？如何評(píng)價(jià)模型的好壞四個(gè)問(wèn)題？同時(shí)，為了讓學(xué)生在實(shí)踐中更好下手，可以依次為各個(gè)問(wèn)題舉例加以說(shuō)明。如查找數(shù)據(jù)庫(kù)環(huán)節(jié)，可以列舉NCBI中的GEO數(shù)據(jù)庫(kù)與美國(guó)政府發(fā)起的癌癥和腫瘤基因圖譜計(jì)劃涉及的TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)兩個(gè)例子，讓學(xué)生先從這兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)獲取相關(guān)的數(shù)據(jù)，對(duì)數(shù)據(jù)本身有所認(rèn)識(shí)，再利用校園網(wǎng)資源查找更多的數(shù)據(jù)庫(kù)。在此過(guò)程中，學(xué)生全程參與項(xiàng)目實(shí)現(xiàn)的各個(gè)流程，不僅學(xué)會(huì)了自主查找資料與學(xué)習(xí)，還提高了同學(xué)間的優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)與團(tuán)隊(duì)協(xié)作的能力，提高學(xué)生學(xué)習(xí)的積極性，獲得獨(dú)立思考的能力。

參考文獻(xiàn)

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篇4

2009年，衛(wèi)生部立項(xiàng)“十二五”八年制規(guī)劃教材《生物信息學(xué)》的編寫工作，并將生物信息學(xué)列為八年制醫(yī)學(xué)生的必修課。這是中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)教育的一件大事，一方面體現(xiàn)國(guó)家對(duì)高等醫(yī)學(xué)人才全面發(fā)展、提高理工科理論水平的重視程度；另一方面也表明生物信息學(xué)理論已經(jīng)深入到生物醫(yī)學(xué)科研和實(shí)際應(yīng)用層面，理論生物醫(yī)學(xué)研究已經(jīng)被國(guó)內(nèi)院校所接受，成為生物醫(yī)學(xué)學(xué)科群的重要組成部分[1]。

生物信息學(xué)是一門新興的交叉學(xué)科，有非常明顯的理工科特性，即在有良好的生物醫(yī)學(xué)背景下，注重?cái)?shù)學(xué)思維和計(jì)算機(jī)操作能力，這對(duì)于我們目前以醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)習(xí)為主的高等醫(yī)學(xué)教育產(chǎn)生一定的挑戰(zhàn)。如何在有限的學(xué)時(shí)基礎(chǔ)上，完成生物信息學(xué)教學(xué)任務(wù)的同時(shí)，讓學(xué)生初步掌握科研、臨床中應(yīng)用生物信息學(xué)的能力，形成理工科處理醫(yī)學(xué)問(wèn)題的思維，是目前在八年制學(xué)生中開展生物信息學(xué)教學(xué)迫切需要研討的問(wèn)題。筆者作為主講教師于哈爾濱醫(yī)科大學(xué)完成了兩輪八年制生物信息學(xué)教學(xué)任務(wù)，通過(guò)教學(xué)過(guò)程、課后調(diào)研及考試分析，總結(jié)了八年制學(xué)生對(duì)學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的一些認(rèn)識(shí)和學(xué)習(xí)期間遇到的問(wèn)題，在這里共同探討，以便于推進(jìn)醫(yī)學(xué)院校生物信息學(xué)的教學(xué)工作，培養(yǎng)更高理論和實(shí)踐層次的醫(yī)學(xué)人才。

一、授課對(duì)象

課程面向臨床醫(yī)學(xué)八年制學(xué)生93人、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)八年制（基地班）學(xué)生60人，學(xué)生入學(xué)錄取分?jǐn)?shù)高于生源地重本線50分以上。開課時(shí)兩個(gè)專業(yè)的學(xué)生均處于大學(xué)三年級(jí)，已經(jīng)學(xué)完高數(shù)、計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)等理工基礎(chǔ)課，分子生物、細(xì)胞生物等生物學(xué)基礎(chǔ)課，以及組胚、生理等醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)課，開課學(xué)期同時(shí)學(xué)習(xí)遺傳、免疫、病理和藥理學(xué)課程；部分學(xué)生參加PBL教學(xué)，已經(jīng)完成呼吸、消化、循環(huán)系統(tǒng)的知識(shí)學(xué)習(xí)。

二、教材和課程內(nèi)容選擇

面向兩個(gè)軌道分別開展《醫(yī)學(xué)信息分析方法》（36學(xué)時(shí)）和《生物信息學(xué)概論》（56學(xué)時(shí)）兩門課程。兩個(gè)軌道均以人民衛(wèi)生出版社規(guī)劃教材《生物信息學(xué)》2010年第一版為主講教材[2]，結(jié)合臨床醫(yī)學(xué)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)的學(xué)科特點(diǎn)，采取教師自主選擇內(nèi)容的方式講授。

在臨床專業(yè)中以疾病理論和分析方法為中心，專題式講解疾病分析相關(guān)資源、研究策略和常用軟件工具。36學(xué)時(shí)的《醫(yī)學(xué)信息分析方法》講授疾病數(shù)據(jù)資源和系統(tǒng)理論、遺傳多態(tài)與疾病定位、轉(zhuǎn)錄調(diào)控信息學(xué)與復(fù)雜疾病分析、miRNA表達(dá)與疾病分類、疾病狀態(tài)表觀遺傳改變，及測(cè)序技術(shù)與疾病研究進(jìn)展等6個(gè)專題。每個(gè)專題包括4學(xué)時(shí)理論課程和2學(xué)時(shí)上機(jī)實(shí)踐。理論課程強(qiáng)調(diào)分子生物學(xué)基礎(chǔ)、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思想和分析理念，實(shí)踐課程以疾病為中心，由教師指引，學(xué)生自主完成一個(gè)小規(guī)模的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)下載到結(jié)果分析的全程化信息學(xué)實(shí)踐。

在基礎(chǔ)專業(yè)中強(qiáng)調(diào)生物醫(yī)學(xué)研究數(shù)據(jù)資源、計(jì)算生物醫(yī)學(xué)方法和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)手段，系統(tǒng)講解生物信息學(xué)在生物醫(yī)學(xué)研究中的理論和實(shí)踐技術(shù)。講授內(nèi)容涉及序列數(shù)據(jù)資源與分析方法、分子進(jìn)化、基因表達(dá)與調(diào)控、蛋白質(zhì)組學(xué)信息學(xué)、網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)生物學(xué)、遺傳和表觀遺傳計(jì)算分析、疾病的計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)等較全面的生物信息學(xué)方法和理論，要求學(xué)生能夠在生物醫(yī)學(xué)研究中貫穿理工科分析思維，不僅能熟練運(yùn)用相應(yīng)的網(wǎng)絡(luò)資源和軟件工具，還能對(duì)生物信息學(xué)方法理論有一定了解，熟悉不同方法的擴(kuò)展性應(yīng)用。理論和實(shí)踐課基本按照2比1分配，實(shí)踐課程根據(jù)內(nèi)容需要選取生物學(xué)或醫(yī)學(xué)問(wèn)題進(jìn)行全程模擬實(shí)驗(yàn)。

三、考試形式和分析

現(xiàn)階段，兩個(gè)八年制專業(yè)的生物信息學(xué)教學(xué)以必修考查課形式進(jìn)行，采取開卷考試、實(shí)驗(yàn)報(bào)告和標(biāo)書設(shè)計(jì)三種考核方式，以便于了解學(xué)生對(duì)本門課程的學(xué)習(xí)和對(duì)生物信息學(xué)研究思想的領(lǐng)悟情況。

開卷考試試題均為主觀題，其中理論基礎(chǔ)題考查概念、重要的研究思路和經(jīng)典的研究方法；案例分析題要求學(xué)生能夠在學(xué)過(guò)的或書本上的知識(shí)基礎(chǔ)上，聯(lián)系生物醫(yī)學(xué)知識(shí)進(jìn)行案例分析，選取相應(yīng)的方法解決特定的問(wèn)題；思維拓展題給定學(xué)生主題詞，由學(xué)生進(jìn)行以生物信息學(xué)方法為工具的課題流程設(shè)計(jì)。考試結(jié)果表明學(xué)生能夠通過(guò)學(xué)習(xí)了解基本的生物信息學(xué)方法，并具備初步運(yùn)用新方法解決實(shí)際問(wèn)題的能力，但考試也反映出，大學(xué)三年級(jí)學(xué)生還具有一定的科研思維局限性，不能夠完全把握課題設(shè)計(jì)過(guò)程的創(chuàng)新性和可靠性原則。

實(shí)踐能力考查主要通過(guò)實(shí)驗(yàn)報(bào)告進(jìn)行，實(shí)驗(yàn)報(bào)告要寫明研究問(wèn)題名稱、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、處理方法、處理結(jié)果和結(jié)果分析討論。通過(guò)實(shí)驗(yàn)報(bào)告的提交，學(xué)生基本能夠就相應(yīng)的問(wèn)題自主選擇數(shù)據(jù)、進(jìn)行一般性軟件分析，并能夠?qū)?shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行知識(shí)面內(nèi)的討論和思考，得出符合問(wèn)題要求的結(jié)論。

標(biāo)書設(shè)計(jì)作為課后實(shí)踐，要求學(xué)生就自己感興趣的研究方向進(jìn)行課題設(shè)計(jì)。設(shè)計(jì)內(nèi)容可以為生物信息學(xué)方法研究，也可以以生物信息學(xué)為工具進(jìn)行生物醫(yī)學(xué)問(wèn)題的探討和分析。大多數(shù)學(xué)生能夠通過(guò)文獻(xiàn)查閱、原先具備的生物醫(yī)學(xué)知識(shí)總結(jié)，發(fā)現(xiàn)有意義的生物醫(yī)學(xué)問(wèn)題，設(shè)計(jì)內(nèi)容具有現(xiàn)實(shí)意義和一定創(chuàng)新性的，部分課題還有較好的可行性。很多標(biāo)書設(shè)計(jì)也暴露出在三年級(jí)開展生物信息學(xué)時(shí)，學(xué)生的臨床醫(yī)學(xué)知識(shí)還比較欠缺，有時(shí)候不能很好的發(fā)現(xiàn)具有醫(yī)學(xué)意義或應(yīng)用價(jià)值的課題，也比較難于理解生物信息學(xué)在實(shí)際應(yīng)用中的價(jià)值。

四、學(xué)生反饋和教學(xué)心得

通過(guò)課堂互動(dòng)、課程臨近結(jié)束時(shí)進(jìn)行的問(wèn)卷調(diào)查，筆者進(jìn)一步了解了學(xué)生在生物信息學(xué)學(xué)習(xí)過(guò)程中的一些困惑，及一些意見(jiàn)和建議。主要問(wèn)題如下：

1、課程理論性強(qiáng)，計(jì)算強(qiáng)度大

學(xué)生們普遍反映生物信息學(xué)與他們學(xué)習(xí)的其他課程不一樣，生物醫(yī)學(xué)課程偏向于文科性質(zhì)，主要靠記憶，而生物信息學(xué)理科特性很強(qiáng)，需要深入理解分析。另外學(xué)生的數(shù)理知識(shí)有限，感到有些算法比較難，根本聽不懂。

2、課程內(nèi)容多，課時(shí)少

許多學(xué)生通過(guò)學(xué)習(xí)對(duì)生物信息學(xué)產(chǎn)生了濃厚的興趣，真切感受到生物信息學(xué)對(duì)于他們未來(lái)的學(xué)習(xí)、科研和臨床工作將有很大幫助，但是課時(shí)太少，不能夠在現(xiàn)有課時(shí)下理解全部理論。

3、實(shí)踐課時(shí)少，計(jì)算機(jī)能力薄弱

絕大多數(shù)學(xué)生都認(rèn)為生物信息學(xué)需要通過(guò)理論結(jié)合實(shí)踐的方法來(lái)學(xué)習(xí)才能更好的掌握。現(xiàn)有的實(shí)踐課程只能完成基本的教學(xué)任務(wù)，對(duì)于眾多的研究工具和研究方法只有感性認(rèn)識(shí)。另外大家在實(shí)踐中也感覺(jué)到自身的計(jì)算機(jī)知識(shí)很有限，在高通量數(shù)據(jù)處理面前力不從心，影響對(duì)問(wèn)題的分析能力。

4、課程開課偏早，背景知識(shí)不全

很多學(xué)生反映三年級(jí)時(shí)，八年制學(xué)生還沒(méi)有進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)、臨床各學(xué)科的培養(yǎng)，知識(shí)背景不足，很難理解生物信息學(xué)中重要的算法公式，也很難對(duì)醫(yī)學(xué)問(wèn)題進(jìn)行更為深入的思考。

學(xué)生們的反饋基本上反映出他們?cè)趯W(xué)習(xí)生物信息學(xué)時(shí)所遇到的困難。筆者所在教研室教師（包括多名規(guī)劃教材的參編者）共同進(jìn)行了深入探討，認(rèn)為應(yīng)當(dāng)根據(jù)學(xué)生意愿向?qū)W校申請(qǐng)①增加理論課課時(shí)，分別由24和36增加為28和44學(xué)時(shí)；②增加實(shí)踐課課時(shí)，分別由12和20增加20和28學(xué)時(shí)；③適當(dāng)降低理論難度，減少不必要的數(shù)學(xué)理論推導(dǎo)，提請(qǐng)學(xué)校為八年制學(xué)生增設(shè)概率統(tǒng)計(jì)和計(jì)算機(jī)編程課程。

生物信息學(xué)的理工科特性決定了生物信息學(xué)課程在醫(yī)學(xué)教育中開展的難度。雖然醫(yī)學(xué)院校學(xué)生課業(yè)重、訓(xùn)練強(qiáng)度大，但是現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)發(fā)展趨勢(shì)告訴我們，生物信息學(xué)必然在未來(lái)的生物醫(yī)學(xué)研究中處于關(guān)鍵地位[3]。不斷改進(jìn)教學(xué)手段、加強(qiáng)教學(xué)過(guò)程的趣味性，更為全面的貫徹以疾病和問(wèn)題為中心的教學(xué)理念，培養(yǎng)理工醫(yī)結(jié)合的現(xiàn)代化醫(yī)學(xué)人才是生物信息教學(xué)工作者共同的努力方向，這些理念在不久的將來(lái)也會(huì)隨著教學(xué)實(shí)踐的不斷深入而在新版《生物信息學(xué)》出版時(shí)得到進(jìn)一步體現(xiàn)。

參考文獻(xiàn)

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篇5

關(guān)鍵詞： 生物信息學(xué) 農(nóng)業(yè)研究領(lǐng)域 應(yīng)用

“生物信息學(xué)”是英文單詞“Bioinformatics”的中文譯名，其概念是1956年在美國(guó)田納西州Gatlinburg召開的“生物學(xué)中的信息理論”討論會(huì)上首次被提出的［1］，由美國(guó)學(xué)者Lim在1991年發(fā)表的文章中首次使用。生物信息學(xué)自產(chǎn)生以來(lái)，大致經(jīng)歷了前基因組時(shí)代、基因組時(shí)代和后基因組時(shí)代三個(gè)發(fā)展階段［2］。2003年4月14日，美國(guó)人類基因組研究項(xiàng)目首席科學(xué)家Collins F博士在華盛頓隆重宣布人類基因組計(jì)劃（Human Genome Project，HGP）的所有目標(biāo)全部實(shí)現(xiàn)［3］。這標(biāo)志著后基因組時(shí)代（Post Genome Era，PGE）的來(lái)臨，是生命科學(xué)史中又一個(gè)里程碑。生物信息學(xué)作為21世紀(jì)生物技術(shù)的核心，已經(jīng)成為現(xiàn)代生命科學(xué)研究中重要的組成部分。研究基因、蛋白質(zhì)和生命，其研究成果必將深刻地影響農(nóng)業(yè)。本文重點(diǎn)闡述生物信息學(xué)在農(nóng)業(yè)模式植物、種質(zhì)資源優(yōu)化、農(nóng)藥的設(shè)計(jì)開發(fā)、作物遺傳育種、生態(tài)環(huán)境改善等方面的最新研究進(jìn)展。

1.生物信息學(xué)在農(nóng)業(yè)模式植物研究領(lǐng)域中的應(yīng)用

1997年5月美國(guó)啟動(dòng)國(guó)家植物基因組計(jì)劃（NPGI），旨在繪出包括玉米、大豆、小麥、大麥、高粱、水稻、棉花、西紅柿和松樹等十多種具有經(jīng)濟(jì)價(jià)值的關(guān)鍵植物的基因圖譜。國(guó)家植物基因組計(jì)劃是與人類基因組工程（HGP）并行的龐大工程［4］。近年來(lái)，通過(guò)各國(guó)科學(xué)家的通力合作，植物基因組研究取得了重大進(jìn)展，擬南芥、水稻等模式植物已完成了全基因組測(cè)序。人們可以使用生物信息學(xué)的方法系統(tǒng)地研究這些重要農(nóng)作物的基因表達(dá)、蛋白質(zhì)互作、蛋白質(zhì)和核酸的定位、代謝物及其調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)等，從而從分子水平上了解細(xì)胞的結(jié)構(gòu)和功能［5］。目前已經(jīng)建立的農(nóng)作物生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)研究平臺(tái)有植物轉(zhuǎn)錄本（TA）集合數(shù)據(jù)庫(kù)TIGR、植物核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)PlantGDB、研究玉米遺傳學(xué)和基因組學(xué)的MazeGDB數(shù)據(jù)庫(kù)、研究草類和水稻的Gramene數(shù)據(jù)庫(kù)、研究馬鈴薯的PoMaMo數(shù)據(jù)庫(kù)，等等。

2.生物信息學(xué)在種質(zhì)資源保存研究領(lǐng)域中的應(yīng)用

種質(zhì)資源是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的重要資源，它包括許多農(nóng)藝性狀（如抗病、產(chǎn)量、品質(zhì)、環(huán)境適應(yīng)性基因等）的等位基因。植物種質(zhì)資源庫(kù)是指以植物種質(zhì)資源為保護(hù)對(duì)象的保存設(shè)施。至1996年，全世界已建成了1300余座植物種質(zhì)資源庫(kù)，在我國(guó)也已建成30多座作物種質(zhì)資源庫(kù)。種質(zhì)入庫(kù)保存類型也從單一的種子形式，發(fā)展到營(yíng)養(yǎng)器官、細(xì)胞和組織，甚至DN段等多種形式。保護(hù)的物種也從有性繁殖植物擴(kuò)展到無(wú)性繁殖植物及頑拗型種子植物等［6］。近年來(lái)，人們?cè)絹?lái)越多地應(yīng)用各種分子標(biāo)記來(lái)鑒定種質(zhì)資源。例如微衛(wèi)星、AFLP、SSAP、RBIP和SNP等。由于對(duì)種質(zhì)資源進(jìn)行分子標(biāo)記產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù)，因此需要建立生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和采用分析工具來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)這些數(shù)據(jù)的查詢、統(tǒng)計(jì)和計(jì)算機(jī)分析等［7］。

3.生物信息學(xué)在農(nóng)藥設(shè)計(jì)開發(fā)研究領(lǐng)域中的應(yīng)用

傳統(tǒng)的藥物研制主要是從大量的天然產(chǎn)物、合成化合物，以及礦物中進(jìn)行篩選，得到一個(gè)可供臨床使用的藥物要耗費(fèi)大量的時(shí)間與金錢。生物信息學(xué)在藥物研發(fā)中的意義在于找到病理過(guò)程中關(guān)鍵性的分子靶標(biāo)、闡明其結(jié)構(gòu)和功能關(guān)系，從而指導(dǎo)設(shè)計(jì)能激活或阻斷生物大分子發(fā)揮其生物功能的治療性藥物，使藥物研發(fā)之路從過(guò)去的偶然和盲目中找到正確的研發(fā)方向。生物信息學(xué)為藥物研發(fā)提供了新的手段［8，9］，導(dǎo)致了藥物研發(fā)模式的改變［10］。目前，生物信息學(xué)促進(jìn)農(nóng)藥研制已有許多成功的例子。Itzstein等設(shè)計(jì)出兩種具有與唾液酸酶結(jié)合化合物：4-氨基-Neu5Ac2en和4-胍基-Neu5Ac2en。其中，后者是前者與唾液酸酶的結(jié)合活性的250倍［11］。目前，這兩種新藥已經(jīng)進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段。TANG SY等學(xué)者研制出新一代抗AIDS藥物saquinavir［12］。Pungpo等已經(jīng)設(shè)計(jì)出幾種新型高效的抗HIV-1型藥物［13］。楊華錚等人設(shè)計(jì)合成了十多類數(shù)百個(gè)除草化合物，經(jīng)生物活性測(cè)定，部分化合物的活性已超過(guò)商品化光合作用抑制劑的水平［14］。

現(xiàn)代農(nóng)藥的研發(fā)已離不開生物信息技術(shù)的參與，隨著生物信息學(xué)技術(shù)的進(jìn)一步完善和發(fā)展，將會(huì)大大降低藥物研發(fā)的成本，提高研發(fā)的質(zhì)量和效率。

4.生物學(xué)信息學(xué)在作物遺傳育種研究領(lǐng)域中的應(yīng)用

隨著主要農(nóng)作物遺傳圖譜精確度的提高，以及特定性狀相關(guān)分子基礎(chǔ)的進(jìn)一步闡明，人們可以利用生物信息學(xué)的方法，先從模式生物中尋找可能的相關(guān)基因，然后在作物中找到相應(yīng)的基因及其位點(diǎn)。農(nóng)作物的遺傳學(xué)和分子生物學(xué)的研究積累了大量的基因序列、分子標(biāo)記、圖譜和功能方面的數(shù)據(jù)，可通過(guò)建立生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)整合這些數(shù)據(jù)，從而比較和分析來(lái)自不同基因組的基因序列、功能和遺傳圖譜位置［15］。在此基礎(chǔ)上，育種學(xué)家就可以應(yīng)用計(jì)算機(jī)模型來(lái)提出預(yù)測(cè)假設(shè)，從多種復(fù)雜的等位基因組合中建立自己所需要的表型，然后從大量遺傳標(biāo)記中篩選到理想的組合，從而培育出新的優(yōu)良農(nóng)作物品種。

5.生物信息學(xué)在生態(tài)環(huán)境平衡研究領(lǐng)域中的應(yīng)用

在生態(tài)系統(tǒng)中，基因流從根本上影響能量流和物質(zhì)流的循環(huán)和運(yùn)轉(zhuǎn)，是生態(tài)平衡穩(wěn)定的根本因素。生物信息學(xué)在環(huán)境領(lǐng)域主要應(yīng)用在控制環(huán)境污染方面，主要通過(guò)數(shù)學(xué)與計(jì)算機(jī)的運(yùn)用構(gòu)建遺傳工程特效菌株，以降解目標(biāo)基因及其目標(biāo)污染物為切入點(diǎn)，通過(guò)降解污染物的分子遺傳物質(zhì)核酸 DNA，以及生物大分子蛋白質(zhì)酶，達(dá)到催化目標(biāo)污染物的降解，從而維護(hù)空氣［16］、水源、土地等生態(tài)環(huán)境的安全。

美國(guó)農(nóng)業(yè)研究中心（ARS） 的農(nóng)藥特性信息數(shù)據(jù)庫(kù)（PPD） 提供 334 種正在廣泛使用的殺蟲劑信息，涉及它們?cè)诃h(huán)境中轉(zhuǎn)運(yùn)和降解途徑的16種最重要的物化特性。日本豐橋技術(shù)大學(xué)（Toyohashi University of Technology） 多環(huán)芳烴危險(xiǎn)性有機(jī)污染物的物化特性、色譜、紫外光譜的譜線圖。美國(guó)環(huán)保局綜合風(fēng)險(xiǎn)信息系統(tǒng)數(shù)據(jù)庫(kù)（IRIS） 涉及 600種化學(xué)污染物，列出了污染物的毒性與風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià)參數(shù)，以及分子遺傳毒性參數(shù)［17］。除此之外，生物信息學(xué)在生物防治［18］中也起到了重要的作用。網(wǎng)絡(luò)的普及，情報(bào)、信息等學(xué)科的資源共享，勢(shì)必會(huì)創(chuàng)造出一個(gè)環(huán)境微生物技術(shù)信息的高速發(fā)展趨勢(shì)。

6.生物信息學(xué)在食品安全研究領(lǐng)域中的應(yīng)用

食品在加工制作和存儲(chǔ)過(guò)程中各種細(xì)菌數(shù)量發(fā)生變化，傳統(tǒng)檢測(cè)方法是進(jìn)行生化鑒定，但所需時(shí)間較長(zhǎng)，不能滿足檢驗(yàn)檢疫部門的要求，運(yùn)用生物信息學(xué)方法獲得各種致病菌的核酸序列，并對(duì)這些序列進(jìn)行比對(duì)，篩選出用于檢測(cè)的引物和探針，進(jìn)而運(yùn)用PCR法［19］、RT-PCR法、熒光RT-PCR法、多重PCR［20］和多重?zé)晒舛縋CR等技術(shù)，可快速準(zhǔn)確地檢測(cè)出細(xì)菌及病毒。此外，對(duì)電阻抗、放射測(cè)量、ELISA法、生物傳感器、基因芯片等［21-25］技術(shù)也是未來(lái)食品病毒檢測(cè)的發(fā)展方向。

轉(zhuǎn)基因食品檢測(cè)是通過(guò)設(shè)計(jì)特異性的引物對(duì)食品樣品的DNA提取物進(jìn)行擴(kuò)增，從而判斷樣品中是否含有外源性基因片段［26］。通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品數(shù)據(jù)庫(kù)信息的及時(shí)更新，可準(zhǔn)確了解各國(guó)新出現(xiàn)和新批準(zhǔn)的轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品，便于查找其插入的外源基因片段，以便及時(shí)對(duì)檢驗(yàn)方法進(jìn)行修改。目前由于某些通過(guò)食品傳播的病毒具有變異特性，以及檢測(cè)方法的不完善等因素影響，生物信息學(xué)在食品領(lǐng)域的應(yīng)用還比較有限，但隨著食品安全檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)的不斷完善，相信相關(guān)的生物信息學(xué)技術(shù)將在食品領(lǐng)域發(fā)揮越來(lái)越重要的作用。

生物信息學(xué)廣泛用于農(nóng)業(yè)科學(xué)研究的各個(gè)領(lǐng)域，但是僅有信息資源是不夠的，選出符合自己需求的生物信息就需要情報(bào)部門，以及信息中介服務(wù)機(jī)構(gòu)提供相關(guān)服務(wù)，通過(guò)出版物、信息共享平臺(tái)、數(shù)字圖書館、電子論壇等信息媒介的幫助，科研工作者可快速有效地找到符合需要的信息。目前我國(guó)生物信息學(xué)發(fā)展還很不均衡，與國(guó)際前沿有一定差距，這需要從事信息和科研的工作者們不斷交流，使得生物信息學(xué)能夠更好地為我國(guó)農(nóng)業(yè)持續(xù)健康發(fā)展發(fā)揮作用。

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篇6

生物信息學(xué)；網(wǎng)絡(luò)資源；計(jì)算機(jī)教學(xué)；改革；自主學(xué)習(xí)

【基金項(xiàng)目】國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(30860278，81160025)；

云南省中青年學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人后備人才資助項(xiàng)目(2011CI057)；

云南省教育廳重大專項(xiàng)(ZD2010007)；

昆明醫(yī)學(xué)院教研教改項(xiàng)目（2011JY38）。

【作者簡(jiǎn)介】謝月輝，女，漢族，昆明醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院計(jì)算機(jī)教研室講師。

【通訊作者】孟照輝，教授，昆明醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院分子心血管研究室主任。

1.生物信息學(xué)及教學(xué)現(xiàn)狀

生物信息學(xué)(Bioinformatics)是生命科學(xué)中一門新興的前沿學(xué)科，是生物學(xué)、數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)等學(xué)科交叉所形成的一門新興學(xué)科。生物信息學(xué)綜合利用計(jì)算機(jī)科學(xué)和信息技術(shù)，通過(guò)對(duì)海量生物學(xué)數(shù)據(jù)的處理和分析，揭示其中蘊(yùn)藏的內(nèi)在聯(lián)系和生物學(xué)含義，進(jìn)而提煉有用的生物學(xué)知識(shí)。生物信息學(xué)的一個(gè)重要內(nèi)容是收集和整理生物學(xué)數(shù)據(jù)，開發(fā)生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，并提供相應(yīng)的數(shù)據(jù)查詢、處理和分析等服務(wù)。隨著互聯(lián)網(wǎng)的普及，這些數(shù)據(jù)庫(kù)大多可以通過(guò)網(wǎng)絡(luò)訪問(wèn)并下載。

伴隨著上世紀(jì)九十年代計(jì)算機(jī)技術(shù)的迅猛發(fā)展，生物信息學(xué)已滲透到生物科學(xué)的每一個(gè)角落，成為生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中的必然選擇；因此，生物信息學(xué)的教學(xué)也日益重要。生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)以互聯(lián)網(wǎng)為媒介，以計(jì)算機(jī)為工具，全部在計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)機(jī)房?jī)?nèi)完成。由于現(xiàn)階段不同專業(yè)學(xué)科的教師之間缺乏交流與合作，很難滿足生物信息學(xué)教學(xué)的需求，特別是在醫(yī)學(xué)院校，生物信息學(xué)教學(xué)仍處于欠缺狀態(tài)。

A.生物信息網(wǎng)絡(luò)資源在計(jì)算機(jī)教學(xué)中應(yīng)用的意義

是醫(yī)學(xué)院校計(jì)算機(jī)教學(xué)進(jìn)一步深化改革，適應(yīng)新型醫(yī)學(xué)人才培養(yǎng)的需要，在多年來(lái)醫(yī)學(xué)院校計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教育改革的探索與實(shí)踐的基礎(chǔ)上，我們對(duì)現(xiàn)今的醫(yī)學(xué)院校計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教育體系提出了新的想法和思路。隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)和互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用的發(fā)展，能否培養(yǎng)出能夠進(jìn)行自我知識(shí)更新、具有強(qiáng)烈的現(xiàn)代信息意識(shí)并能夠利用信息技術(shù)解決實(shí)際問(wèn)題的新型醫(yī)學(xué)人才，是擺在我們面前的一項(xiàng)重大研究課題。生物學(xué)數(shù)據(jù)量增長(zhǎng)極為迅速，但生物數(shù)據(jù)資源的利用率卻很不理想。在高校教學(xué)中，生物信息學(xué)尚未有完善的教學(xué)模式，在醫(yī)學(xué)院校的教學(xué)中甚至處于欠缺的狀態(tài)。將生物信息網(wǎng)絡(luò)資源引入計(jì)算機(jī)教學(xué)當(dāng)中，可充實(shí)計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)教育內(nèi)容，培養(yǎng)學(xué)生自學(xué)和文獻(xiàn)檢索能力，提高學(xué)生的學(xué)習(xí)和研究興趣及解決學(xué)習(xí)中碰到的實(shí)際問(wèn)題，使學(xué)生在了解和掌握大學(xué)計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)的同時(shí)認(rèn)識(shí)到計(jì)算機(jī)教學(xué)的目的性和實(shí)用性，以適應(yīng)當(dāng)前新型醫(yī)學(xué)人才培養(yǎng)的需要。將生物信息網(wǎng)絡(luò)資源的應(yīng)用與計(jì)算機(jī)教學(xué)相結(jié)合是醫(yī)學(xué)院校計(jì)算機(jī)教學(xué)中的重要課題，也是對(duì)計(jì)算機(jī)教學(xué)的一個(gè)挑戰(zhàn)。

B.適應(yīng)醫(yī)學(xué)教育現(xiàn)代化的要求，推動(dòng)醫(yī)學(xué)教育的發(fā)展

近二十年來(lái)，生物學(xué)數(shù)據(jù)如潮水般涌現(xiàn)，并正以指數(shù)方式增長(zhǎng)，但我們對(duì)相關(guān)數(shù)據(jù)的理解卻十分有限。生物信息學(xué)是生物學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)交叉結(jié)合形成的新學(xué)科，它綜合運(yùn)用數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和信息技術(shù)等手段，通過(guò)生物信息的獲取、處理、存儲(chǔ)、分發(fā)、分析等來(lái)理解和闡明大量數(shù)據(jù)所包含的生物學(xué)意義。生物信息學(xué)的發(fā)展已經(jīng)使生物學(xué)研究從傳統(tǒng)的試驗(yàn)分析和數(shù)據(jù)積累轉(zhuǎn)移到數(shù)據(jù)分析及其指導(dǎo)下的試驗(yàn)驗(yàn)證上來(lái)，因此，生物信息學(xué)將對(duì)醫(yī)學(xué)教育、生命科學(xué)研究及醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的繁榮與發(fā)展產(chǎn)生重大影響。為趕上現(xiàn)代醫(yī)學(xué)發(fā)展步伐，將計(jì)算機(jī)技術(shù)有效地應(yīng)用到醫(yī)學(xué)教育及科研領(lǐng)域中去已成為我國(guó)醫(yī)學(xué)教育的一項(xiàng)戰(zhàn)略任務(wù)。

目前，生物信息學(xué)教學(xué)條件尚不成熟，缺乏完善的教學(xué)模式；因此，如何在高校進(jìn)行生物信息學(xué)教學(xué)亟需探索。在此，我們希望探討在計(jì)算機(jī)教學(xué)中如何與生物信息學(xué)有機(jī)結(jié)合，更好地適應(yīng)醫(yī)學(xué)教育現(xiàn)代化的要求,推動(dòng)醫(yī)學(xué)教育的發(fā)展。

2.醫(yī)學(xué)院校計(jì)算機(jī)教學(xué)中引入生物信息網(wǎng)絡(luò)資源的具體實(shí)施方法

目前，醫(yī)學(xué)院校計(jì)算機(jī)教學(xué)集中在大學(xué)一、二年級(jí)的一個(gè)學(xué)年，有些是在一個(gè)學(xué)期內(nèi)完成，其教學(xué)內(nèi)容主要由理論教學(xué)、實(shí)驗(yàn)教學(xué)和自主學(xué)習(xí)三部分組成，這三部分交替進(jìn)行。值得注意的是，PBL(Problem-based Learming，也稱作問(wèn)題式學(xué)習(xí))的教學(xué)方法在醫(yī)學(xué)院校受到了推崇；它采用“以問(wèn)題為導(dǎo)向的教學(xué)方法”和設(shè)計(jì)真實(shí)性任務(wù)相結(jié)合的教學(xué)模式，把學(xué)習(xí)設(shè)置于復(fù)雜的、有意義的現(xiàn)實(shí)問(wèn)題中，通過(guò)學(xué)習(xí)者的自主探究和合作來(lái)解決問(wèn)題，從而學(xué)習(xí)隱含在問(wèn)題背后的科學(xué)知識(shí)，形成解決問(wèn)題的技能和自主學(xué)習(xí)的能力，真正達(dá)到醫(yī)學(xué)計(jì)算機(jī)教學(xué)的目的。生物信息網(wǎng)絡(luò)資源的應(yīng)用教學(xué)正是基于這種方法完成，主要分為三步進(jìn)行：

A.在教學(xué)的初期，首先提出生物信息學(xué)的學(xué)習(xí)計(jì)劃

教師在計(jì)算機(jī)理論教學(xué)時(shí)向?qū)W生簡(jiǎn)要說(shuō)明進(jìn)行生物信息網(wǎng)絡(luò)資源應(yīng)用的學(xué)習(xí)計(jì)劃：通過(guò)網(wǎng)絡(luò)，自主學(xué)習(xí)了解生物信息學(xué)（教學(xué)初期開始，中期前完成）；由教師在機(jī)房講解并做示范，然后由學(xué)生自行操作完成生物信息網(wǎng)絡(luò)資源的應(yīng)用（教學(xué)中期開始，可持續(xù)幾周時(shí)間，在本科目考試前兩周完成，提交報(bào)告）；教師評(píng)價(jià)學(xué)生的報(bào)告并給出成績(jī)，此成績(jī)占計(jì)算機(jī)學(xué)科成績(jī)的一定比例。

在教學(xué)初期，指導(dǎo)學(xué)生通過(guò)網(wǎng)絡(luò)自主學(xué)習(xí)并初步了解生物信息學(xué)的概念、發(fā)展等基本知識(shí)。在此過(guò)程中，可讓學(xué)生以小班為單位通過(guò)電子郵件的形式把學(xué)習(xí)的進(jìn)展情況反饋給老師，以檢查和督促學(xué)生的學(xué)習(xí)。

B.在教學(xué)中后期進(jìn)行具體的指導(dǎo)學(xué)習(xí)

教學(xué)內(nèi)容包括問(wèn)題設(shè)置以及具體操作流程；教學(xué)模式將結(jié)合分子生物學(xué)和基因工程等相關(guān)學(xué)科，建立以教學(xué)內(nèi)容為核心的科研實(shí)驗(yàn)和學(xué)生標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)。主要由以下步驟組成——設(shè)置主題：給出一個(gè)待查詢基因或蛋白質(zhì)的英文全名或者代碼；給出常用網(wǎng)址：包括常用數(shù)據(jù)庫(kù)、文獻(xiàn)和應(yīng)用軟件等；查詢結(jié)果：指導(dǎo)學(xué)生如何從中獲取所需信息數(shù)據(jù)；提交報(bào)告：內(nèi)容包括使用的網(wǎng)站名，數(shù)據(jù)庫(kù)版本及所獲得的基因序列、氨基酸序列及編碼等；教師作出評(píng)價(jià)。

C.讓學(xué)生熟悉相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)及能從中找到并分析特定的數(shù)據(jù)是生物信息學(xué)教學(xué)的核心內(nèi)容

隨著大量生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)積累，目前已有數(shù)以百計(jì)的生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)，如日本的DDBJ、歐洲的EMBL、SWISS-PROT和美國(guó)的GenBank、PDB均是國(guó)際上著名的一級(jí)核酸或蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)，如何讓學(xué)生了解一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)、掌握常用的二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)使用方法，針對(duì)醫(yī)學(xué)生的特點(diǎn)一般而言，采用問(wèn)題設(shè)置以及操作演示的教學(xué)方法讓學(xué)生在較短時(shí)間內(nèi)掌握最常用數(shù)據(jù)庫(kù)的使用方法。具體方法如下：

篇7

隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)和生物技術(shù)的快速發(fā)展，MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)課程不僅是計(jì)算機(jī)類專業(yè)、信息管理專業(yè)的重要專業(yè)課程，也是生物信息學(xué)專業(yè)的必修課程。MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)作為應(yīng)用型課程，其課程體系注重培養(yǎng)學(xué)生利用數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)解決實(shí)際問(wèn)題的能力，然而由于專業(yè)方向、教學(xué)手段、考核方式等方面的限制，容易使學(xué)生學(xué)習(xí)目標(biāo)不明確、缺乏學(xué)習(xí)興趣，導(dǎo)致學(xué)習(xí)效果較差。如何改變生物信息學(xué)專業(yè)的MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)現(xiàn)狀，是值得深入思考的問(wèn)題，該文從教學(xué)實(shí)踐出發(fā)，探討MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)課程在生物信息學(xué)專業(yè)中的重要性和教學(xué)方法。

1 MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)特點(diǎn)

MySQL由瑞典MySQL AB公司開發(fā)的一款開放源碼的中小型關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)，是當(dāng)前網(wǎng)站開發(fā)中尤其是PHP開發(fā)中使用最為廣泛的數(shù)據(jù)庫(kù)。MySQL支持多線程充分利用CPU資源，提供TCP/IP、ODBC和JDBC等多種數(shù)據(jù)庫(kù)連接途徑，支持Linux、Solaris和Windows等多種操作系統(tǒng)，使用系統(tǒng)核心提供的多線程機(jī)制提供完全的多線程運(yùn)行模式，提供了面向C、C++、Java、Perl、PHP和Python等編程語(yǔ)言接口，優(yōu)化SQL查詢算法，可有效地提高查詢速度。它具有操作簡(jiǎn)單、體積小、速度快等優(yōu)點(diǎn)，語(yǔ)法簡(jiǎn)單，容易被學(xué)生理解和接受，在編寫網(wǎng)站應(yīng)用程序時(shí)，幾乎離不開數(shù)據(jù)庫(kù)，所以，在教學(xué)中選取MySQL作為教學(xué)用數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)。

2 MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)課程教學(xué)方法研究

MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)具有很多特點(diǎn)，是網(wǎng)站應(yīng)用程序不可缺少的重要部分。對(duì)于生物信息學(xué)專業(yè)的學(xué)生而言，使用很多數(shù)據(jù)庫(kù)，如，NCBI、UCSC等進(jìn)行生物數(shù)據(jù)檢索，而獲得數(shù)據(jù)后，如何進(jìn)行數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、數(shù)據(jù)處理和分析成為一個(gè)重點(diǎn)難點(diǎn)問(wèn)題。學(xué)習(xí)MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)課程，能使學(xué)生快速地掌握使用方法，提高處理數(shù)據(jù)效率。為保證良好的MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)教學(xué)效果，從以下幾方面開展教學(xué)方法研究和實(shí)踐。

2.1 理論與實(shí)踐緊密結(jié)合，調(diào)動(dòng)學(xué)生學(xué)習(xí)興趣

根據(jù)MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)理論性和應(yīng)用性強(qiáng)的特點(diǎn)，為使學(xué)生全面掌握數(shù)據(jù)庫(kù)基本知識(shí)和技能，提出理論與實(shí)踐緊密結(jié)合的教學(xué)方法，重視課堂理論知識(shí)的傳授，緊密結(jié)合實(shí)踐訓(xùn)練。例如：理論學(xué)習(xí)關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)模型時(shí)，引入實(shí)例，指導(dǎo)學(xué)生從GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)獲取核酸和蛋白質(zhì)序列，調(diào)動(dòng)學(xué)生主動(dòng)思考，如何存儲(chǔ)為關(guān)系模型數(shù)據(jù)，加深學(xué)生對(duì)關(guān)系模型的理解和應(yīng)用，并為同學(xué)分配任務(wù)，進(jìn)行核酸和蛋白質(zhì)序列的查詢、修改關(guān)系操作，通過(guò)這種具有專業(yè)特色的理論學(xué)習(xí)與實(shí)踐訓(xùn)練相結(jié)合的教學(xué)方法，使學(xué)生掌握了MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)理論知識(shí)的同時(shí)，也激勵(lì)同學(xué)主動(dòng)開展實(shí)踐訓(xùn)練，能夠使枯燥的理論知識(shí)變得生動(dòng)有趣，使學(xué)生認(rèn)識(shí)到MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)課程的重要性，進(jìn)一步促進(jìn)生物信息學(xué)專業(yè)課程的學(xué)習(xí)。

2.2 項(xiàng)目與任務(wù)驅(qū)動(dòng)結(jié)合，培養(yǎng)學(xué)生動(dòng)手能力

針對(duì)MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)課程的特點(diǎn)，開展項(xiàng)目與任務(wù)緊密結(jié)合的教學(xué)方法。總體上將課程劃分為若干階段的教學(xué)過(guò)程，并將教學(xué)過(guò)程分解在一個(gè)項(xiàng)目案例MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)中。例如：構(gòu)建人類疾病相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)，將該項(xiàng)目劃分按照數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)周期劃分為以下6個(gè)階段：需求分析階段、概念結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)階段、邏輯結(jié)構(gòu)高設(shè)計(jì)階段、物理結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)階段，數(shù)據(jù)庫(kù)實(shí)施階段和數(shù)據(jù)庫(kù)運(yùn)行與維護(hù)階段，分配子項(xiàng)目和子任務(wù)，包括人類疾病相關(guān)基因數(shù)據(jù)的獲得與處理、轉(zhuǎn)化為關(guān)系模型結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)、數(shù)據(jù)模式分解、MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建、關(guān)系表構(gòu)建、數(shù)據(jù)類型設(shè)置、數(shù)據(jù)導(dǎo)入、創(chuàng)建索引、視圖、觸發(fā)器以及存儲(chǔ)過(guò)程等，充分調(diào)動(dòng)學(xué)生學(xué)習(xí)的主動(dòng)性，發(fā)揮主觀能動(dòng)性，用項(xiàng)目和任務(wù)引導(dǎo)學(xué)生學(xué)習(xí)知識(shí)點(diǎn)，即把知識(shí)點(diǎn)的講授貫穿在實(shí)際應(yīng)用項(xiàng)目的開發(fā)過(guò)程之中，指導(dǎo)學(xué)生掌握實(shí)際的MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)的分析、設(shè)計(jì)與開發(fā)過(guò)程，培養(yǎng)學(xué)生動(dòng)手研發(fā)能力。

2.3 考核與教學(xué)反思結(jié)合，優(yōu)化教學(xué)內(nèi)容

目前，MySQL的數(shù)據(jù)庫(kù)課程理論與實(shí)踐考核存在考核過(guò)程效率低、考核內(nèi)容覆蓋面小、考核方法少等問(wèn)題使教師難以全面掌握學(xué)生的學(xué)習(xí)效果，所以，在考核過(guò)程中督促學(xué)生全面掌握數(shù)據(jù)庫(kù)相關(guān)知識(shí)，提出了可靠的理論與實(shí)踐考核方法，即制訂合理的考核內(nèi)容計(jì)劃，構(gòu)建全面的數(shù)據(jù)庫(kù)、試題庫(kù)、理論試題庫(kù)和實(shí)踐試題庫(kù)，全面覆蓋表與數(shù)據(jù)庫(kù)的創(chuàng)建、表結(jié)構(gòu)的修改及索引的創(chuàng)建、數(shù)據(jù)操作、查詢及視圖、觸發(fā)器與存儲(chǔ)過(guò)程的創(chuàng)建、用戶與權(quán)限管理等，結(jié)合生物信息學(xué)專業(yè)知識(shí)進(jìn)行理論和實(shí)踐考試，保證理論考試和實(shí)踐考試能夠全面真實(shí)地反映學(xué)生的掌握水平。同時(shí)，進(jìn)行教學(xué)反思，即時(shí)糾正教學(xué)過(guò)程中還存在的問(wèn)題，對(duì)于課堂上學(xué)生提出的一些獨(dú)特見(jiàn)解給予充分肯定，推廣的好方法、好思路、好見(jiàn)解，完善教學(xué)過(guò)程，拓寬教師的教學(xué)思路，提高教學(xué)水平。

篇8

關(guān)鍵詞：蛋白質(zhì)組；雙向電泳；雙向電泳；植物

中圖分類號(hào)：Q946.1文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A

由于基因的功能主要通過(guò)其編碼的蛋白質(zhì)來(lái)實(shí)現(xiàn)，因此蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)真正的執(zhí)行者。蛋白質(zhì)組學(xué)是后基因組時(shí)代功能基因組學(xué)研究的新興學(xué)科和熱點(diǎn)領(lǐng)域，借助于多種技術(shù)從整體水平研究生物體內(nèi)蛋白質(zhì)。Cordwell等于1997年提出了功能蛋白質(zhì)組（functional　proteome）的概念，即在特定時(shí)間、特定環(huán)境和實(shí)驗(yàn)條件下基因組活躍表達(dá)的蛋白。蛋白質(zhì)組學(xué)研究主要包括蛋白的表達(dá)模式和蛋白的功能模式兩個(gè)方面。

1蛋白質(zhì)組分離技術(shù)

合理的樣品制備是獲得高分辨率、高重復(fù)性的2-DE圖譜的保證。植物蛋白質(zhì)常用提取方法包括：酚提取法、分步提取法和TCA-丙酮沉淀法等。為了增加蛋白溶解液的溶解能力，常加入離液劑、表面活性劑、還原劑等。為了更好的使胞內(nèi)低組分蛋白在2-DE膠中得以成像，蛋白的染色技術(shù)就顯得至關(guān)重要。常用的蛋白質(zhì)的染色方法有銀染法、考馬斯亮藍(lán)染色、熒光染色、負(fù)染法和同位素標(biāo)記等。利用圖像分析系統(tǒng)對(duì)2-DE凝膠圖像進(jìn)行保存，以利于進(jìn)一步的分析。圖像采集時(shí)，要注意掃描系統(tǒng)的分辨率及掃描方式，保證捕獲的蛋白點(diǎn)的光密度信息與蛋白點(diǎn)的表達(dá)豐度成正比。然后進(jìn)行圖像分析，包括斑點(diǎn)檢測(cè)、背景消減、斑點(diǎn)配比和數(shù)據(jù)分析。

2蛋白質(zhì)組鑒定技術(shù)

質(zhì)譜技術(shù)具有高靈敏度、高通量及自動(dòng)化，從而能與蛋白質(zhì)組大規(guī)模研究相適應(yīng)。其原理是將樣品分子離子化，根據(jù)離子間質(zhì)荷比（m/z）的差異來(lái)分離并確定相對(duì)分子質(zhì)量。質(zhì)譜鑒定主要有兩種方法：肽質(zhì)量指紋圖譜法（peptide　mass　fingerprint，PMF）和肽序列標(biāo)簽法（peptide　sequence　tag，PST）。肽質(zhì)量指紋圖譜的原理是通過(guò)測(cè)定一個(gè)蛋白質(zhì)酶解混合物中肽段的電離飛行時(shí)間來(lái)確定其分子量等數(shù)據(jù)，這一圖譜對(duì)蛋白質(zhì)應(yīng)是專一而特異，然后所得的肽片斷質(zhì)量與數(shù)據(jù)庫(kù)中理論肽質(zhì)量相匹配。肽序列標(biāo)簽技術(shù)是經(jīng)質(zhì)譜分析的肽段進(jìn)一步斷裂，分解為氨基酸或含有C末端的片斷，再次進(jìn)行質(zhì)譜分析，得到肽序列信息。片斷的數(shù)據(jù)不僅可以在蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)中搜尋，還可以在核酸數(shù)據(jù)庫(kù)，如EST數(shù)據(jù)庫(kù)中搜尋。

3蛋白質(zhì)組生物信息學(xué)技術(shù)

生物信息學(xué)通過(guò)對(duì)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的采集、加工、存儲(chǔ)、檢索與分析，達(dá)到解釋數(shù)據(jù)所蘊(yùn)含的生物學(xué)意義的目的。在進(jìn)行蛋白質(zhì)功能預(yù)測(cè)和結(jié)構(gòu)分析時(shí)，生物信息學(xué)就成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究的核心技術(shù)之一。目前蛋白質(zhì)組生物信息學(xué)主要圍繞對(duì)雙向電泳、質(zhì)譜、蛋白質(zhì)測(cè)序等實(shí)驗(yàn)技術(shù)獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息的獲取與加工等。數(shù)據(jù)庫(kù)是蛋白質(zhì)組研究水平的標(biāo)志和基礎(chǔ)。隨著蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)的建立，出現(xiàn)了許多蛋白質(zhì)組輔助分析軟件，主要包括三類：2-DE凝膠成像分析軟件、蛋白鑒定分析軟件和蛋白特征化軟件。蛋白質(zhì)組研究依賴于生物信息學(xué)的理論、技術(shù)與數(shù)據(jù)庫(kù)，為迅速準(zhǔn)確地研究和鑒定蛋白質(zhì)奠定了基礎(chǔ)。

4雙向電泳技術(shù)在植物基因功能研究中的應(yīng)用

植物在生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中會(huì)受到各種不利環(huán)境因子如高溫、低溫、干旱和高鹽等，植物感受這些逆境信號(hào)后通過(guò)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)抗逆相關(guān)蛋白的表達(dá)，進(jìn)而調(diào)整自身的生理狀態(tài)或形態(tài)的改變來(lái)適應(yīng)不利環(huán)境。利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)為我們尋找更多且更有效的新抗逆相關(guān)基因或蛋白開辟了新的方向。

Bongani等以擬南芥細(xì)胞懸浮培養(yǎng)物為材料，系統(tǒng)研究了鹽脅迫和高滲脅迫對(duì)植物細(xì)胞蛋白質(zhì)的影響。研究發(fā)現(xiàn)在脅迫條件下有266個(gè)蛋白表現(xiàn)出豐度的變化。鑒定出了75個(gè)差異蛋白，分屬于10個(gè)功能類型［1］。Lee等研究了水稻葉片在低溫脅迫下低豐度蛋白的表達(dá)。蛋白樣品經(jīng)雙向電泳分離，使用MALDI-TOF質(zhì)譜技術(shù)及ESI　MS-MS技術(shù)分析鑒定蛋白點(diǎn)，共發(fā)現(xiàn)12個(gè)上調(diào)表達(dá)蛋白，同時(shí)鑒定出一些新的蛋白，為進(jìn)一步提高轉(zhuǎn)基因植物的耐冷性的研究提供了理論基礎(chǔ)［2］。Li等利用雙向電泳技術(shù)和MALDI-TOF/MS技術(shù)分析了鐵離子對(duì)番茄根中蛋白表達(dá)的影響，共得到97個(gè)差異表達(dá)的蛋白，其中上調(diào)表達(dá)蛋白涉及代謝途徑［3］。采用2-DE技術(shù)對(duì)轉(zhuǎn)基因prosystemin煙草植株葉片進(jìn)行蛋白質(zhì)組分析，研究表明番茄中系統(tǒng)素基因在煙草中組成型表達(dá)影響蛋白合成，經(jīng)統(tǒng)計(jì)分析，顯著差異的蛋白點(diǎn)為21個(gè)［4］。

采用蛋白質(zhì)組學(xué)的方法分析CA-OsRac1水稻，共檢測(cè)到258個(gè)表達(dá)發(fā)生變化的蛋白，其中206個(gè)被上調(diào)，52個(gè)被下調(diào)。SE激發(fā)子誘導(dǎo)100個(gè)蛋白表達(dá)，其中87個(gè)同時(shí)也是受CA-OsRac1調(diào)控，這表明OsRac1在抗病反應(yīng)中起很重要的作用［5］。為了研究超表達(dá)S-腺苷甲硫氨酸脫羧酶（AdoMetDC）對(duì)轉(zhuǎn)基因植株影響和多胺分解，采用蛋白質(zhì)組技術(shù)分析轉(zhuǎn)基因煙草葉片蛋白質(zhì)組。研究發(fā)現(xiàn)，在轉(zhuǎn)基因植株中只有一系列葉綠體核糖白同源異構(gòu)體發(fā)生變化，且蛋白表達(dá)豐度降低。同時(shí)，超表達(dá)AdoMetDC引起　PR1防衛(wèi)蛋白家族8個(gè)同源異構(gòu)體的上調(diào)表達(dá)，如PR-1a，PR-1b　和PR-1c等［6］。

5結(jié)論

蛋白質(zhì)組學(xué)是蛋白質(zhì)水平上直接研究基因功能的有效工具。但蛋白質(zhì)組技術(shù)仍存在一些問(wèn)題，如蛋白樣品制備效率低；疏水性蛋白分離難度大；蛋白質(zhì)組定量問(wèn)題等。并且植物中大部分蛋白未能有效鑒定，植物蛋白質(zhì)組學(xué)研究仍主要集中在少數(shù)測(cè)序的植物。隨著蛋白質(zhì)研究技術(shù)不斷完善，以及植物EST數(shù)據(jù)庫(kù)的豐富，蛋白質(zhì)組學(xué)在植物脅迫應(yīng)答調(diào)控途徑中研究將越來(lái)越廣泛和深入。

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［4］Rocco　M，Corrado　G，Arena　S，et　al．，The　expression　of　tomato　prosystemin　gene　in　tobacco　plants　highly　affects　host　proteomic　repertoire．J．Proteomics，2008（71）：176-185．

篇9

細(xì)節(jié)推斷題相對(duì)來(lái)講其涵蓋的范圍比較廣泛，涉及題目的各個(gè)方面和細(xì)節(jié)，對(duì)于考生來(lái)說(shuō)難度較高。在出題的過(guò)程中容易設(shè)置思維陷阱，如果考生稍不留神，很可能被誤導(dǎo)造成錯(cuò)選。因此，要把握好細(xì)節(jié)推斷題，就要充分了解題目設(shè)置的陷阱有哪些，有備無(wú)患自然萬(wàn)無(wú)一失。

細(xì)節(jié)推斷題的解題關(guān)鍵是掌握這種試題在命題中常用的五大命題陷阱，即：范圍錯(cuò)誤、概念錯(cuò)誤、邏輯錯(cuò)誤、程度錯(cuò)誤、過(guò)度推理。

【真題演練】

基于細(xì)節(jié)題以上的特點(diǎn)，我們要明確哪些陷阱容易在出題是設(shè)置。我們根據(jù)設(shè)置陷阱的方式，把細(xì)節(jié)題分為如下五類：

一、范圍錯(cuò)誤

1.世界遺產(chǎn)公約規(guī)定，世界遺產(chǎn)所在地國(guó)家必須保證遺產(chǎn)的真實(shí)性和完整性。世界遺產(chǎn)的功能，第一層是科學(xué)研究，第二層是教育功能，最后才是旅游功能。目前很多地方都在逐步改正，但還有諸多不盡人意的地方。

從這段文字我們不能推出的是（）。

A．世界遺產(chǎn)所在地國(guó)家應(yīng)該妥善保護(hù)世界遺產(chǎn)

B．世界遺產(chǎn)最寶貴的價(jià)值是其科學(xué)研究?jī)r(jià)值

C．目前仍有不少違反世界遺產(chǎn)公約的行為存在

D．所有世界遺產(chǎn)所在地國(guó)家都過(guò)分注重其旅游功能

【解析】D是正確答案。根據(jù)語(yǔ)段“世界遺產(chǎn)所在地國(guó)家必須保證遺產(chǎn)的真實(shí)性和完整性”，可以推知A；根據(jù)語(yǔ)段“世界遺產(chǎn)的功能，第一層是科學(xué)研究”，我們可以推知B；根據(jù)語(yǔ)段“目前很多地方都在逐步改正，但還有諸多不盡人意的地方”，我們可以推知C；D的表述過(guò)于絕對(duì)，并非所有的國(guó)家都有如此行為，而是語(yǔ)段中的“很多地方”，因此屬于擴(kuò)大范圍錯(cuò)誤。

二、概念錯(cuò)誤

2.信息科學(xué)和醫(yī)學(xué)的結(jié)合將產(chǎn)生不可估量的影響。遠(yuǎn)程醫(yī)療將得到普及，智能機(jī)器人用于診斷和治療已初見(jiàn)端倪，生物信息學(xué)不僅將用于大量生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)及處理、分析與儲(chǔ)存，而且將直接用于醫(yī)療技術(shù)中。

對(duì)這段話理解不準(zhǔn)確的是（）。

A.遠(yuǎn)程醫(yī)療將得到普及

B.利用生物學(xué)對(duì)大量生物醫(yī)療數(shù)據(jù)進(jìn)行處理、分析與儲(chǔ)存

C.智能機(jī)器人用于診斷和治療已初見(jiàn)端倪

D.生物信息學(xué)將直接用于醫(yī)療技術(shù)中。

【解析】B本題考查的是片段閱讀中常見(jiàn)的錯(cuò)誤選項(xiàng)設(shè)置形式——偷換概念。

3.自然資源稀缺，產(chǎn)權(quán)就非常重要。因?yàn)楫a(chǎn)權(quán)明確，人們?cè)僖膊粫?huì)超負(fù)荷放牧。到發(fā)達(dá)國(guó)家農(nóng)牧業(yè)地區(qū)看過(guò)的人都知道，分割牧場(chǎng)使用的都是鐵絲網(wǎng)，這全是君子界線，堵不住小人。但是在一個(gè)法制的社會(huì)，這種防君子不防小人的界線，是具有法律權(quán)威的。難怪有一本書說(shuō)鐵絲網(wǎng)是19世紀(jì)人類社會(huì)十大發(fā)明之一。

下面不符合這段話所表達(dá)的意思的是（）。

A．產(chǎn)權(quán)的劃分要有法律來(lái)保障

B．鐵絲網(wǎng)只有在法制社會(huì)才起作用

C．法律能約束君子但不能約束小人

D．產(chǎn)權(quán)明確可以防止自然資源的過(guò)度開發(fā)

【解析】C是正確答案。典型的概念偷換，從語(yǔ)段中“分割牧場(chǎng)使用的都是鐵絲網(wǎng)，這全是君子界線，堵不住小人”，可知C將“鐵絲網(wǎng)”偷換成“法律”，故C錯(cuò)誤；A從語(yǔ)段首句和倒數(shù)第二句可以推出；B可以根據(jù)語(yǔ)段“但是在一個(gè)法制的社會(huì)，這種防君子不防小人的界線，是具有法律權(quán)威的”推出；D可以從語(yǔ)段的“因?yàn)楫a(chǎn)權(quán)明確，人們?cè)僖膊粫?huì)超負(fù)荷放牧”中推出。

“生物信息學(xué)”偷換成“生物學(xué)”。

三、邏輯錯(cuò)誤

4．幽默使人如沐春風(fēng)，也能解除尷尬。一個(gè)懂得幽默的人，會(huì)知道如何化解眼前的障礙。我們有時(shí)無(wú)意中讓緊張代替了輕松，讓嚴(yán)肅代替了平易，一不小心就變成了無(wú)趣的人。

對(duì)這段話，理解不準(zhǔn)確的是（）。

A．緊張的生活需要幽默調(diào)劑B．許多人在生活中不擅長(zhǎng)使用幽默

C．生活中，幽默可以化解許多難堪D．有情趣的生活，是因?yàn)橛辛擞哪?/p>

【解析】DD項(xiàng)是明顯的邏輯錯(cuò)誤。材料強(qiáng)調(diào)幽默可化解眼前的障礙，使人變得輕松起來(lái)，增加了生活的情趣。邏輯關(guān)系為：幽默是原因，生活有情趣是結(jié)果。D選項(xiàng)剛好犯了邏輯顛倒的錯(cuò)誤。

5．運(yùn)動(dòng)損傷后，經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的治療和休息，腫脹、疼痛癥狀逐漸消失，許多人以為完全康復(fù)了，其實(shí)不然。在損傷恢復(fù)的后期，仍要在不加重疼痛的前提下，加強(qiáng)受傷部位的功能性鍛煉，防止受傷部位因長(zhǎng)期代謝障礙而引起組織變形或功能改變，只有這樣才能徹底康復(fù)。根據(jù)這段話，理解正確的是（）。

A．運(yùn)動(dòng)損傷后要經(jīng)過(guò)長(zhǎng)時(shí)間的治療和休息

B．功能性鍛煉是運(yùn)動(dòng)損傷的輔助治療手段

C．損傷恢復(fù)后期是進(jìn)行功能性鍛煉的最佳階段

D．根據(jù)疼痛癥狀是否消失可以確定病人是否康復(fù)

【解析】B從“在損傷恢復(fù)的后期，仍要在不加重疼痛的前提下，加強(qiáng)受傷部位的功能性鍛煉，防止受傷部位因長(zhǎng)期代謝障礙而引起組織變形或功能改變，只有這樣才能徹底康復(fù)”可知：功能性鍛煉是運(yùn)動(dòng)損傷的輔助治療手段。A項(xiàng)“經(jīng)過(guò)長(zhǎng)時(shí)間的治療和休息”的說(shuō)法，屬于邏輯錯(cuò)誤，將“功能性鍛煉”等同于“治療和休息”。C選項(xiàng)中所謂“最佳階段”，并不能從文中得出這個(gè)結(jié)論。D項(xiàng)明顯曲解文意。

四、程度錯(cuò)誤

6．專家認(rèn)為，如果汽車技術(shù)行業(yè)經(jīng)過(guò)長(zhǎng)年的研發(fā)能降低3％的油耗，就可以算是非常顯著的研究成果了；但即使是能降低3％的油耗，對(duì)實(shí)際生活中的消費(fèi)者來(lái)說(shuō)也不太明顯。而且汽車生產(chǎn)廠家在不影響加速動(dòng)力性的情況下，已經(jīng)在盡量省油，目前生產(chǎn)的汽車在節(jié)油和動(dòng)力方面的效果已經(jīng)達(dá)到了最佳配置比。

根據(jù)這段話，以下說(shuō)法正確的是（）。

A．汽車消費(fèi)者對(duì)能否節(jié)約3％的汽油不在乎

B．目前生產(chǎn)的汽車已經(jīng)達(dá)到了最佳的制動(dòng)效果

C．無(wú)論汽車技術(shù)怎么發(fā)展，節(jié)油效果都不會(huì)很顯著

D．在節(jié)油和動(dòng)力的最佳配置比方面再尋求突破難度很大

【解析】D“對(duì)實(shí)際生活中的消費(fèi)者來(lái)說(shuō)也不太明顯”并不是說(shuō)“消費(fèi)者對(duì)能否節(jié)約3％的汽油不在乎”，故A程度把握不正確；B選項(xiàng)偷換概念，把“節(jié)油和動(dòng)力方面的效果”偷換為“制動(dòng)效果”。C明顯程度錯(cuò)誤。根據(jù)“目前生產(chǎn)的汽車在節(jié)油和動(dòng)力方面的效果已經(jīng)達(dá)到了最佳配置比”知既然是最佳，再尋求突破當(dāng)然難度很大。

五、過(guò)度推理

7.這段長(zhǎng)城是明代長(zhǎng)城的一部分，在軍事上有著極其重要的戰(zhàn)略意義。它西面的古北口，是進(jìn)關(guān)的必經(jīng)之路，歷來(lái)是兵家必爭(zhēng)之地。明大將徐達(dá)當(dāng)初督修的這段長(zhǎng)城，高不過(guò)一丈二尺，寬不過(guò)九尺。到明穆宗慶隆元年，戚繼光鎮(zhèn)守北疆，又調(diào)集士卒繼續(xù)進(jìn)行艱巨的修墻、筑臺(tái)工程。據(jù)記載，在戚繼光鎮(zhèn)守北疆的十六年間，北部邊防沒(méi)有出現(xiàn)過(guò)大的動(dòng)亂。京師的安全得到了可靠的保證。

這段話沒(méi)有包含下列哪個(gè)觀點(diǎn)？（）

A．這段長(zhǎng)城是明代長(zhǎng)城的一部分，戚繼光主持修的長(zhǎng)城比徐達(dá)督修的長(zhǎng)城更高、更長(zhǎng)

B．這段長(zhǎng)城在軍事上有著極其重要的戰(zhàn)略意義

C．這段長(zhǎng)城據(jù)守著進(jìn)關(guān)的必經(jīng)之路，是兵家必爭(zhēng)之地

篇10

本書共有28章，分為11部分。第1部分 轉(zhuǎn)化研究的障礙，含第1-2章：1.轉(zhuǎn)化研究的復(fù)雜性；2.甲基化、蛋氨酸與隱喻。

第2部分 臨床應(yīng)用中的整合新興科學(xué)，含第3-6章：3.臨床醫(yī)學(xué)中的整合新興科學(xué)；4.微小RNA在人類疾病中的臨床意義；5.整合新興科學(xué)進(jìn)入臨床實(shí)踐：不切除治療轉(zhuǎn)移性前列腺癌；6.早期癌癥臨床實(shí)驗(yàn)?zāi)技赫系K與機(jī)會(huì)。

第3部分 轉(zhuǎn)化研究的組織、優(yōu)化、評(píng)述與資金支持。含7-8章：7.癌癥相關(guān)的基金項(xiàng)目；8.生物醫(yī)學(xué)進(jìn)行轉(zhuǎn)化研究中同行評(píng)議過(guò)程的挑戰(zhàn)。

第4部分 癌癥研究中的轉(zhuǎn)化科學(xué)，含第9-12章：9.對(duì)癌癥患者臨床實(shí)驗(yàn)轉(zhuǎn)化性新興免疫案例的理解；10.癌癥中酪氨酸激酶抑制劑的轉(zhuǎn)化性研究；11.兒童與青少年b細(xì)胞淋巴癌：從研究到臨床再到研究；12.基于肺癌的轉(zhuǎn)化研究的進(jìn)展。

第5部分 傳染病學(xué)中的轉(zhuǎn)化科學(xué)，含第13章：13.傳染病分子診斷的轉(zhuǎn)化研究。

第6部分 內(nèi)分泌學(xué)與營(yíng)養(yǎng)學(xué)中的轉(zhuǎn)化科學(xué)，含第14-16章：14.臨床實(shí)踐研究：肥胖學(xué)；15.肥胖與二型糖尿病的轉(zhuǎn)化研究；16.轉(zhuǎn)化科學(xué)進(jìn)入實(shí)踐：肥胖病與糖尿病患者需要什么？

第7部分 轉(zhuǎn)化科學(xué)與神經(jīng)系統(tǒng)學(xué)，含第17-19章：17.轉(zhuǎn)化性神經(jīng)系統(tǒng)學(xué)：從數(shù)學(xué)模型到臨床實(shí)踐；18.老年癡呆癥：根據(jù)臨床前與臨床研究討論“研究到臨床”與“臨床到研究”兩條路線；19.神經(jīng)干細(xì)胞病毒療法治療多形性成膠質(zhì)細(xì)胞瘤：轉(zhuǎn)化方面。

第8部分 干細(xì)胞與轉(zhuǎn)化科學(xué)，含第20-21章：20.干細(xì)胞與轉(zhuǎn)化研究的挑戰(zhàn)；21.干細(xì)胞與轉(zhuǎn)化研究。

第9部分 轉(zhuǎn)化科學(xué)對(duì)公共衛(wèi)生與行為科學(xué)的作用，含第22-23章：22.吸食煙草與癌癥患者之間的關(guān)系；23.行為學(xué)與公共衛(wèi)生中轉(zhuǎn)化科學(xué)的作用。

第10部分 轉(zhuǎn)化流行病學(xué)、生物統(tǒng)計(jì)學(xué)與信息學(xué)，含第24-25章：24.轉(zhuǎn)化流行病、生物統(tǒng)計(jì)學(xué)與生物信息學(xué)；25.臨床實(shí)踐中個(gè)性化醫(yī)療的研究方法：系統(tǒng)回顧。